33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2311 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  954    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  39.25 
 
 
405 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  36 
 
 
385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  36 
 
 
385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  32.03 
 
 
385 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  31.44 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  35.83 
 
 
397 aa  113  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  37.19 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  29.5 
 
 
385 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  29.5 
 
 
385 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  33.85 
 
 
391 aa  106  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  36.05 
 
 
401 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  33.46 
 
 
392 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  32.02 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  31.35 
 
 
388 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  32.29 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  32.29 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  32.16 
 
 
385 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  28.87 
 
 
304 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  32.89 
 
 
376 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  32.32 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  35.76 
 
 
250 aa  67  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  31.99 
 
 
375 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  25.5 
 
 
310 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  26.85 
 
 
274 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  27.94 
 
 
337 aa  60.1  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  24.71 
 
 
311 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2615  hypothetical protein  30.3 
 
 
554 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  29.94 
 
 
295 aa  57.4  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  27.14 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  32.42 
 
 
312 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  25.82 
 
 
309 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  31.16 
 
 
316 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>