15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2615 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2615  hypothetical protein  100 
 
 
554 aa  1131    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  30.38 
 
 
397 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  29.3 
 
 
391 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  29.66 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  28.12 
 
 
385 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  28.12 
 
 
385 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  27.8 
 
 
391 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  28.05 
 
 
401 aa  50.4  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  25.09 
 
 
385 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  25.46 
 
 
385 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  25.09 
 
 
385 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  28.12 
 
 
385 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  24.58 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  28.12 
 
 
385 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  28.12 
 
 
385 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>