14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0967 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0967  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0950  hypothetical protein  88.03 
 
 
304 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0445  hypothetical protein  32.89 
 
 
262 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0252  hypothetical protein  27.27 
 
 
308 aa  63.5  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.511229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  36.24 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1914  hypothetical protein  29.61 
 
 
178 aa  53.1  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  24.6 
 
 
337 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  27.1 
 
 
405 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  29.61 
 
 
385 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  29.61 
 
 
385 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  28.95 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  28.29 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  28.29 
 
 
385 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  28.29 
 
 
385 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>