More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1520 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1520  transport system permease protein  100 
 
 
315 aa  597  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0838  transport system permease protein  40.92 
 
 
331 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  36.86 
 
 
357 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0115  transport system permease protein  32.9 
 
 
320 aa  149  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0713  transport system permease protein  38.57 
 
 
347 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  34.31 
 
 
345 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  37.96 
 
 
351 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  35.2 
 
 
328 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  35.92 
 
 
351 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  34.35 
 
 
373 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  35.87 
 
 
329 aa  139  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  33.1 
 
 
362 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  36.86 
 
 
358 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  32.28 
 
 
368 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0761  iron-compound ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
347 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  33.97 
 
 
367 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  34.38 
 
 
367 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  36.69 
 
 
376 aa  136  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  35.44 
 
 
352 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.81 
 
 
337 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  33.78 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  34.74 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.04 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  32.71 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  32.33 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  32.71 
 
 
364 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  32.09 
 
 
385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  37.98 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.52 
 
 
330 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  34.84 
 
 
347 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
380 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1389  iron (III) ABC transporter, permease  33.44 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.953687  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  35.03 
 
 
354 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  35.18 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  32.51 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  34.88 
 
 
334 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  36.55 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.52 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  34.97 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  37.46 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  32.36 
 
 
331 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  35.71 
 
 
344 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1117  transport system permease protein  35.54 
 
 
349 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  33.56 
 
 
356 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33.81 
 
 
350 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  38.26 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  32.76 
 
 
332 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  32.4 
 
 
336 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0841  transport system permease protein  32.48 
 
 
382 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  36.81 
 
 
353 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  34.39 
 
 
332 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.62 
 
 
381 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  37.01 
 
 
340 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  34.32 
 
 
323 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3279  transport system permease protein  32.27 
 
 
381 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  35.51 
 
 
346 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 
343 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  34.95 
 
 
372 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  36.63 
 
 
338 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  35.31 
 
 
322 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  31.88 
 
 
360 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  34.64 
 
 
348 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2493  transport system permease protein  33.69 
 
 
325 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.357055 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  35.94 
 
 
312 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1332  transport system permease protein  37.23 
 
 
346 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.200312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  34.84 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3181  transport system permease protein  32.15 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  36.03 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  33.22 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  34.69 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  34.41 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  34.81 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3575  transport system permease protein  33.23 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3190  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.35 
 
 
371 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  34.34 
 
 
370 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  36.46 
 
 
353 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2033  iron compound ABC transporter, permease protein  38.35 
 
 
352 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.409984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  37.72 
 
 
338 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  38.35 
 
 
366 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  30.38 
 
 
336 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1895  iron chelate ABC transporter permease protein  38.35 
 
 
352 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273368  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  33.02 
 
 
336 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  32.88 
 
 
315 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  28.93 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3151  iron chelate ABC transporter permease protein  38.35 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0881  iron chelate ABC transporter permease protein  38.35 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.626277  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2715  iron chelate ABC transporter permease protein  38.35 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.27 
 
 
639 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  34.71 
 
 
350 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3206  FecCD-family membrane transporter protein  36.4 
 
 
371 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  33.77 
 
 
345 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  34.34 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  37.8 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  34.3 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  34.3 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  33.45 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  34.3 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  34.42 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  33.8 
 
 
330 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>