More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0115 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0115  transport system permease protein  100 
 
 		 320 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0838  transport system permease protein  41.1 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  36.61 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  33.44 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  35.56 
 
 		 346 aa  169  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.22 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.68 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  34.11 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  37.1 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  35.89 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  34.6 
 
 		 345 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  35.42 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  33.55 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1520  transport system permease protein  33.22 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.71 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  33.91 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  34.6 
 
 		 354 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  33.33 
 
 		 372 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  36.52 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.49 
 
 		 367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  33.68 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  32.81 
 
 		 375 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  32.42 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  36.05 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  36.68 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  32.13 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  31.97 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  33.9 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  32.62 
 
 		 351 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  34.81 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  35.12 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  33.33 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  31.6 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  33.22 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  33.91 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  33.68 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  33.22 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  32.91 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  30.53 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  31.14 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3279  transport system permease protein  32.59 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  31.14 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0754  FecCD transport family protein  33.77 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.671626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  31.4 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  32.91 
 
 		 364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  34.27 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  32.54 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3181  transport system permease protein  32.57 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  33.44 
 
 		 327 aa  145  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  33.68 
 
 		 352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  32.17 
 
 		 348 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  32.48 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  32.48 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  32.48 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  32.28 
 
 		 385 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  33.44 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  33.63 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  33.33 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0761  iron-compound ABC transporter, permease protein  33.79 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3190  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  34.98 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  29.68 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 366 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  32.17 
 
 		 348 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  31.82 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2033  iron compound ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.409984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  34.49 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3151  iron chelate ABC transporter permease protein  34.98 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2715  iron chelate ABC transporter permease protein  34.98 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0881  iron chelate ABC transporter permease protein  34.98 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.626277  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1895  iron chelate ABC transporter permease protein  34.98 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273368  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0841  transport system permease protein  32.57 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  34.01 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  31.53 
 
 		 363 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  32.07 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  32.59 
 
 		 353 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  31.74 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  36.61 
 
 		 345 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3206  FecCD-family membrane transporter protein  34.63 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  31 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  32.18 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  31.21 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  34.58 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  31.25 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1389  iron (III) ABC transporter, permease  32.53 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.953687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  32.51 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0713  transport system permease protein  31.41 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  32.75 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  32.08 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  34.15 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  32 
 
 		 355 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  34.95 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  36.7 
 
 		 345 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  31.51 
 
 		 374 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  33.1 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  32.98 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  35.5 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  30.84 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  36.58 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>