245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0690 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0690  sodium-dependent transporter  100 
 
 
440 aa  838    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1969  sodium-dependent transporter  84.83 
 
 
439 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08661  putative sodium-dependent transporter, NSS family protein  74.03 
 
 
444 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14351  SNF family Na(+)-dependent transporter  63.86 
 
 
442 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0684124  hitchhiker  0.00560218 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0750  SNF family Na(+)-dependent transporter  62.64 
 
 
441 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15901  sodium-dependent transporter  62.64 
 
 
441 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  55.73 
 
 
447 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  55.38 
 
 
447 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  55.05 
 
 
447 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1223  SNF family Na(+)-dependent transporter  55.84 
 
 
449 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  43.42 
 
 
442 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  37.53 
 
 
453 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  37.67 
 
 
454 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.26 
 
 
449 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  38.24 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  36.17 
 
 
457 aa  221  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  34.23 
 
 
446 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  35.04 
 
 
446 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  34.79 
 
 
446 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  34.79 
 
 
446 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  36.61 
 
 
443 aa  210  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  34.79 
 
 
446 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  34.94 
 
 
446 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  37.56 
 
 
451 aa  209  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  34.1 
 
 
473 aa  208  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  39.32 
 
 
472 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.59 
 
 
452 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  34.55 
 
 
446 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  34.55 
 
 
446 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  34.55 
 
 
446 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  40.76 
 
 
475 aa  206  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  36.59 
 
 
452 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  34.06 
 
 
446 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  34.31 
 
 
446 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  37.94 
 
 
446 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  34.73 
 
 
486 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  34.41 
 
 
443 aa  203  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  36 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  36.53 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  36.61 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  39.69 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.07 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2007  sodium:neurotransmitter symporter  40.45 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  37.05 
 
 
488 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  38.46 
 
 
431 aa  199  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  36.3 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  36.3 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  36.07 
 
 
445 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  37.1 
 
 
445 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  36.07 
 
 
445 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  34.9 
 
 
452 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  35.84 
 
 
445 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  36.36 
 
 
447 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  36.07 
 
 
445 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  33.57 
 
 
448 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  36.91 
 
 
461 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  35.84 
 
 
445 aa  194  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  34.17 
 
 
450 aa  193  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  35.91 
 
 
447 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  31.63 
 
 
461 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  36.11 
 
 
456 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  32.75 
 
 
457 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  32.88 
 
 
453 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
470 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  33.33 
 
 
474 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.52 
 
 
468 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  31.98 
 
 
451 aa  186  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.7 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  35.14 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  35.41 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  34.51 
 
 
448 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  35.65 
 
 
454 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0530  sodium- and chloride-dependent transporter  33.03 
 
 
445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  35.2 
 
 
459 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  35.79 
 
 
451 aa  183  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  32.43 
 
 
486 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  35.55 
 
 
457 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  36.18 
 
 
453 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  31.45 
 
 
446 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  31.45 
 
 
446 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  32.65 
 
 
450 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 
450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  29.68 
 
 
502 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  36.36 
 
 
452 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  33.03 
 
 
449 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  32.82 
 
 
437 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  33.97 
 
 
450 aa  178  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  33.63 
 
 
452 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  31.66 
 
 
445 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1198  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  32.03 
 
 
444 aa  177  5e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  30.61 
 
 
447 aa  176  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 
463 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  36.01 
 
 
503 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  29.53 
 
 
454 aa  176  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  34.51 
 
 
464 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  36.27 
 
 
503 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  36.43 
 
 
503 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 
448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  35.68 
 
 
464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  30.5 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>