245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1223 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1223  SNF family Na(+)-dependent transporter  100 
 
 
449 aa  875    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  98.66 
 
 
447 aa  864    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  92.17 
 
 
447 aa  780    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  97.99 
 
 
447 aa  814    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14351  SNF family Na(+)-dependent transporter  62.13 
 
 
442 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0684124  hitchhiker  0.00560218 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0750  SNF family Na(+)-dependent transporter  60.82 
 
 
441 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15901  sodium-dependent transporter  60.82 
 
 
441 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08661  putative sodium-dependent transporter, NSS family protein  57.99 
 
 
444 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1969  sodium-dependent transporter  57.11 
 
 
439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0690  sodium-dependent transporter  55.84 
 
 
440 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  42.11 
 
 
442 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  37.5 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  36.99 
 
 
454 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
446 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
446 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.33 
 
 
455 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  35.97 
 
 
446 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  35.97 
 
 
446 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  36.2 
 
 
446 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  35.97 
 
 
446 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
446 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  39.57 
 
 
473 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  36.82 
 
 
459 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  43.44 
 
 
475 aa  227  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  36.82 
 
 
446 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  36.58 
 
 
452 aa  227  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.75 
 
 
446 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.75 
 
 
446 aa  226  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  35.97 
 
 
446 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  33.92 
 
 
449 aa  225  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  37.53 
 
 
468 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  38.31 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  37.87 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  37.19 
 
 
445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  37.19 
 
 
445 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 
452 aa  220  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  36.96 
 
 
445 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  37.19 
 
 
445 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  37.64 
 
 
445 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  34.97 
 
 
473 aa  219  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  37.64 
 
 
445 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.19 
 
 
445 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  35.38 
 
 
448 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  34.67 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  36.43 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  37.7 
 
 
447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  36.82 
 
 
445 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 
443 aa  213  7e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  34.56 
 
 
457 aa  213  7.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  38.52 
 
 
448 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 
453 aa  212  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  34.77 
 
 
472 aa  211  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  35.47 
 
 
451 aa  211  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  34.72 
 
 
452 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  36.02 
 
 
476 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  37.79 
 
 
450 aa  210  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  32.4 
 
 
454 aa  209  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  33.98 
 
 
488 aa  206  5e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  34.51 
 
 
451 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 
493 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  35.83 
 
 
494 aa  206  6e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  33.63 
 
 
448 aa  206  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.76 
 
 
458 aa  205  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  35.71 
 
 
454 aa  205  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  34.92 
 
 
431 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  36.09 
 
 
431 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  31.6 
 
 
447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  32.58 
 
 
469 aa  200  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  31.37 
 
 
447 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  31.37 
 
 
447 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  33.77 
 
 
461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  37.47 
 
 
474 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  35.97 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  35.78 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2007  sodium:neurotransmitter symporter  38.4 
 
 
475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  33.05 
 
 
502 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 
459 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.6 
 
 
449 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  33.84 
 
 
470 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  32.58 
 
 
450 aa  196  7e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  33.26 
 
 
444 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  33.78 
 
 
457 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.59 
 
 
456 aa  196  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  36.01 
 
 
448 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  36.43 
 
 
503 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  36.69 
 
 
503 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 
449 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  32.73 
 
 
457 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  36.95 
 
 
503 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  30.59 
 
 
454 aa  193  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  31.97 
 
 
446 aa  193  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  35 
 
 
437 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  32.51 
 
 
447 aa  191  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  34.23 
 
 
452 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  33.93 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 
510 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  32.95 
 
 
461 aa  189  8e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  31.03 
 
 
453 aa  189  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>