92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0143 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0143  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
849 aa  1738    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0671969  normal  0.0206287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
384 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0056  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
363 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
374 aa  56.2  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
393 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
385 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
359 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
379 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 
381 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1307  glycosyltransferase-like protein  36.36 
 
 
357 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.325648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
386 aa  52.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0316  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
424 aa  52.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.451798  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
439 aa  52  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
393 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0825  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
434 aa  51.6  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
380 aa  50.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
384 aa  50.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
360 aa  50.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1603  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
335 aa  50.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.535279  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3431  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
424 aa  49.7  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 
739 aa  50.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  21.26 
 
 
377 aa  49.7  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
412 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  30.43 
 
 
378 aa  49.3  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
412 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0522  hypothetical protein  41.56 
 
 
341 aa  49.7  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
370 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  36.23 
 
 
352 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4208  hypothetical protein  27.81 
 
 
422 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
374 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
392 aa  48.9  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
382 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
392 aa  48.9  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49124  predicted protein  23.19 
 
 
444 aa  48.9  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469563  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2591  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
478 aa  48.9  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.97646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4707  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
378 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.103608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 
426 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
812 aa  48.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
383 aa  48.5  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
368 aa  48.5  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0352  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
322 aa  48.5  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
415 aa  48.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
364 aa  47.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
371 aa  47.8  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  19.54 
 
 
672 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
380 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
406 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  21.53 
 
 
388 aa  47.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
412 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  26.49 
 
 
378 aa  47.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 
360 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3441  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
894 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  21.94 
 
 
370 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.72 
 
 
352 aa  47  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  27.08 
 
 
360 aa  47.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
404 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  20.94 
 
 
385 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  21.6 
 
 
367 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
375 aa  46.2  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
435 aa  46.6  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
392 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
370 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5728  putative glycosyltransferase  25.35 
 
 
332 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
360 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
377 aa  45.8  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
376 aa  45.8  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
374 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
360 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
412 aa  45.8  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.49 
 
 
349 aa  45.8  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2155  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
427 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.824181  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0857  a-glycosyltransferase  25.23 
 
 
373 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.1 
 
 
369 aa  46.2  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  30 
 
 
347 aa  45.4  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0432  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
356 aa  45.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
367 aa  45.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
367 aa  45.4  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1818  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
382 aa  45.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
360 aa  45.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
386 aa  45.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  24.51 
 
 
372 aa  45.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
386 aa  45.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.14 
 
 
478 aa  44.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 
440 aa  44.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2745  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
341 aa  44.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
412 aa  44.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
365 aa  44.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
383 aa  44.3  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
384 aa  44.3  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  23.23 
 
 
366 aa  44.3  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
368 aa  44.3  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  40.82 
 
 
415 aa  44.3  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>