More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2155 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2155  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
427 aa  864    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.824181  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3710  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
399 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0312  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
380 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.018829  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4346  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
413 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.795348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4315  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4582  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4587  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
429 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
402 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  17.92 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
385 aa  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.29 
 
 
360 aa  63.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
412 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
396 aa  63.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  41.25 
 
 
384 aa  63.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
387 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
1079 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
1080 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
790 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3507  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
403 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.89342e-22 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
384 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
385 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
383 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
421 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
386 aa  59.7  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
427 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  31.13 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  30.67 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  27.31 
 
 
822 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.71 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
374 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
385 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  29.17 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
382 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
412 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
800 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
409 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
380 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
397 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 
373 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
374 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
361 aa  57.4  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
364 aa  57.4  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  26.39 
 
 
370 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
419 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
414 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
399 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.97 
 
 
416 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  21.99 
 
 
396 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
356 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  31.78 
 
 
347 aa  57  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
372 aa  57  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
394 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
389 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  28.12 
 
 
371 aa  56.2  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0648  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.75 
 
 
431 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  37.38 
 
 
457 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3017  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
360 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  31.64 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27.11 
 
 
366 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  20.11 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
439 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  31.82 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1432  glycosyltransferase  23.89 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  21.96 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
345 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
440 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>