109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4346 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4346  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
413 aa  831    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.795348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4315  glycosyl transferase group 1  48.42 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4582  glycosyl transferase group 1  42.7 
 
 
457 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3710  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 
399 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3507  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
403 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.89342e-22 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0312  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
380 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.018829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4587  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
429 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2155  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
427 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.824181  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.57 
 
 
373 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
440 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 
373 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0522  hypothetical protein  19.55 
 
 
341 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  20.18 
 
 
352 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
362 aa  51.6  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 
416 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1307  glycosyltransferase-like protein  23.53 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.325648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  20.22 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.39 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
366 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
460 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
376 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 
369 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
361 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.53 
 
 
536 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  39.73 
 
 
437 aa  47.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
410 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 
380 aa  47  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
380 aa  47  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
364 aa  47  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  30.91 
 
 
351 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 
382 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
370 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
410 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  29.41 
 
 
358 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  21.62 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  36.47 
 
 
718 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  21.4 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  22.6 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
358 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.89 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0868  a-glycosyltransferase  24.71 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0630159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.89 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.89 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  27.42 
 
 
347 aa  45.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  39.47 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
609 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.53 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
418 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 
407 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  17.74 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 
355 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
420 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
420 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  34.85 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  22.15 
 
 
350 aa  43.9  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
384 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
364 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
1915 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
399 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
364 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.11 
 
 
350 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
369 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1499  glycosyl transferase, group 1  20.55 
 
 
371 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.415023  normal  0.860019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
425 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  22.95 
 
 
364 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  28.57 
 
 
371 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>