99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3507 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3507  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
403 aa  823    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.89342e-22 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4582  glycosyl transferase group 1  47.1 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3710  glycosyl transferase group 1  44.82 
 
 
399 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4315  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0312  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.018829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4346  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
413 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.795348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4587  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  22.07 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2155  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
427 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.824181  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
348 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  32.26 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
346 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
420 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
420 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  20.45 
 
 
360 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
377 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  26.11 
 
 
392 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
366 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
371 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
412 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  31.61 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  28.72 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.71 
 
 
409 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
374 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
401 aa  46.6  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
384 aa  47  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  28.21 
 
 
411 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  25.81 
 
 
347 aa  46.6  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  21.64 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  22.05 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  41.07 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  38.98 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  26.56 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  28.18 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
361 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  20.71 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
378 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
386 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0522  hypothetical protein  30.12 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.97 
 
 
406 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0553  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
403 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
351 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
353 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
310 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
393 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
374 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  35.38 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
416 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
387 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
428 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 
414 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
366 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  20.6 
 
 
371 aa  43.5  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
370 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
395 aa  43.1  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
363 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
381 aa  43.5  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
382 aa  43.1  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
371 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
355 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
389 aa  43.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
417 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
383 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
380 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>