45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4582 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4582  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 457 aa  923    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3710  glycosyl transferase group 1  56.91 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3507  glycosyl transferase group 1  47.1 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.89342e-22 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4315  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4346  glycosyl transferase group 1  42.7 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.795348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0312  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 380 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.018829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2155  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.824181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4587  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  21.99 
 
 		 378 aa  53.5  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  19.5 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  21.4 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.01 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 381 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1603  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.535279  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 382 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 361 aa  47.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 421 aa  47.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  18.62 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  18.62 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 322 aa  47  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  20.75 
 
 		 380 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  20.75 
 
 		 380 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 377 aa  46.6  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0522  hypothetical protein  22.01 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  18.98 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 383 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 384 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.9 
 
 		 374 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 		 374 aa  43.9  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  22.61 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  22.08 
 
 		 358 aa  43.1  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>