35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0312 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0312  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
380 aa  781    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.018829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3507  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
403 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.89342e-22 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3710  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4315  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
427 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4582  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
457 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4346  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
413 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.795348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2155  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
427 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.824181  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4587  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0522  hypothetical protein  26.57 
 
 
341 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  30.36 
 
 
1219 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  22.63 
 
 
359 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
395 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
365 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
403 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  20.12 
 
 
385 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6402  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
401 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
310 aa  47  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 
355 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
455 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  29.81 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
384 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
1177 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 
386 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
366 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  21.81 
 
 
410 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
377 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0215  glycosyltransferase  24.88 
 
 
379 aa  43.9  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
373 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
360 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
1177 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.69 
 
 
373 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
351 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>