58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4315 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4315  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 427 aa  848    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4346  glycosyl transferase group 1  48.42 
 
 		 413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.795348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3507  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.89342e-22 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3710  glycosyl transferase group 1  42.16 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4582  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0312  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.018829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4587  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 429 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2155  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.824181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 378 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  29 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0522  hypothetical protein  20.61 
 
 		 341 aa  50.8  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 		 352 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 		 361 aa  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.72 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  20.07 
 
 		 365 aa  47.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  31.67 
 
 		 347 aa  47.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 		 407 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 403 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 		 380 aa  46.6  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  22.3 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 355 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  38.57 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.09 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.21 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  25 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4202  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.11 
 
 		 364 aa  43.9  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  28.64 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  32.94 
 
 		 411 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 387 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 458 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  21.71 
 
 		 350 aa  43.1  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 		 381 aa  43.1  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>