61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5728 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5728  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 332 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001780  putative glycosyltransferase  40.87 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.31 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  25.5 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 452 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 419 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1076  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 379 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0352  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 440 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0143  glycosyltransferase-like protein  25.35 
 
 		 849 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0671969  normal  0.0206287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 426 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  24 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3017  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.28 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.53 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 438 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1261  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 400 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 739 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.15 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  31.25 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 		 379 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.24 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>