More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1244 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1244  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 380 aa  742    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0775  glycosyl transferase, group 1  55.56 
 
 		 390 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0942  glycosyl transferase, group 1  51.19 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3125  glycosyl transferase, group 1  39.63 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 399 aa  121  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.93 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 374 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  38.61 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.83 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  36.8 
 
 		 376 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  33.72 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  38.59 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  30.51 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  37.31 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  37.31 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  29.17 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 381 aa  85.9  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  41.36 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.57 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.21 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.21 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.14 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.14 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.14 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.14 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.14 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 		 750 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.14 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.35 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.81 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  37.02 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.18 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 		 739 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.26 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  27.87 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0632  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.68 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.21 
 
 		 745 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  35.68 
 
 		 822 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.13 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  25.64 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  42.59 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 		 704 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>