More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3125 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3125  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 406 aa  801    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1244  glycosyl transferase, group 1  39.37 
 
 		 380 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292801 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0942  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0775  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 		 390 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.81 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 374 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.57 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 370 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1806  hypothetical protein  42.61 
 
 		 139 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  29.95 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  34.13 
 
 		 822 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  26 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 		 398 aa  87.4  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 395 aa  86.3  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.96 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  25.82 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.02 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  23.7 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1803  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  26.93 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  29.66 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.14 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 		 1080 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.45 
 
 		 769 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3566  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  37.43 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  31.25 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  26.79 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  30.77 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1422  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  28.1 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3395  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.74 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3347  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  29.06 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  24.18 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>