193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0226 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0226  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1002  gluconolactonase  42.55 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.968927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0305  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.46 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  35.56 
 
 
299 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0906  gluconolactonase  35.24 
 
 
299 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.35 
 
 
273 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1935  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.51 
 
 
314 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  35.15 
 
 
296 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  36.21 
 
 
283 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  36.21 
 
 
283 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  36.21 
 
 
283 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.33 
 
 
299 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7307  gluconolactonase  34.62 
 
 
296 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.54 
 
 
297 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.72 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2119  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.01 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6822  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.47 
 
 
276 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2345  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.99 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0169935  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1822  gluconolactonase  29.43 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.14 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4143  gluconolactonase  30.6 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670498  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  27.82 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  24.54 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  33.96 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  27.21 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  31.25 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  27.44 
 
 
328 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.67 
 
 
581 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.56 
 
 
290 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1013  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.39 
 
 
278 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  28.78 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  28.36 
 
 
323 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2370  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.14 
 
 
290 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  28.49 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  28.71 
 
 
533 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29900  gluconolactonase  29.69 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  28.62 
 
 
313 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  25.62 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3544  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.81 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0286848 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  28.62 
 
 
313 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00470  conserved hypothetical protein  34.17 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  25.74 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  32.31 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.3 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.45 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  30.46 
 
 
280 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  28.26 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.65 
 
 
312 aa  55.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  28.26 
 
 
316 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  28.26 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4224  gluconolactonase  27.65 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  25.54 
 
 
303 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.76 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.91 
 
 
407 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  25.74 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0919  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.78 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0524  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.65 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  24.16 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2637  senescence marker protein-30 family protein  32.06 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0164591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.62 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.31 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.64 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  25.84 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  25.37 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.33 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  30 
 
 
290 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  24.36 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  26.46 
 
 
309 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  25.45 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  28.19 
 
 
363 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  26.57 
 
 
312 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  35.48 
 
 
296 aa  52.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.85 
 
 
309 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.33 
 
 
300 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.33 
 
 
300 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  24.24 
 
 
307 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.25 
 
 
302 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  27.4 
 
 
357 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  34.45 
 
 
307 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  27.82 
 
 
280 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.9 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5175  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.81 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0979633  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5444  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.55 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  26.28 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3944  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.68 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  26.01 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  31.36 
 
 
299 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.78 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2536  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.37 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  27.8 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  21.76 
 
 
318 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  21.76 
 
 
318 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  32.77 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  26.73 
 
 
281 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  33.62 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0044  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.37 
 
 
296 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2670  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.55 
 
 
574 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142476  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  24.26 
 
 
307 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>