64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2705 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2705  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 205 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1154  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  62.07 
 
 		 195 aa  256  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3752  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.12 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3835  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.6 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.999673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3694  exonuclease  27.6 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.558751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  29.38 
 
 		 578 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  28.22 
 
 		 570 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.16 
 
 		 960 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1295  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.16 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.961159  normal  0.477064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  30.16 
 
 		 585 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.02 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.63 
 
 		 921 aa  52  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2006  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.65 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.473172  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  27.27 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  26.87 
 
 		 1390 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3823  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.91 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  30.41 
 
 		 601 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  26.47 
 
 		 902 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0478  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.36 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  23.38 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.5 
 
 		 595 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1068  DNA polymerase III, epsilon chain  27.66 
 
 		 277 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0816  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.84 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0768  exonuclease  27.92 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.11 
 
 		 610 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  29.23 
 
 		 551 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1452  DNA polymerase III subunit epsilon  34.94 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.53 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3933  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.08 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0812308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.67 
 
 		 927 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0820  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.92 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.36 
 
 		 609 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  25.87 
 
 		 1367 aa  46.2  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  25.87 
 
 		 1367 aa  46.2  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2477  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.98 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  25.12 
 
 		 180 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  24.74 
 
 		 578 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4339  DNA polymerase III subunit epsilon  32.47 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0266  DNA polymerase III subunit epsilon  32.97 
 
 		 240 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  27 
 
 		 359 aa  45.1  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  25.37 
 
 		 616 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  26.09 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  25.74 
 
 		 613 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  24.55 
 
 		 897 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.1 
 
 		 462 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0826  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.14 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.458335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0637  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.14 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  24.55 
 
 		 897 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  26.34 
 
 		 603 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0904  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.57 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.42 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  27.59 
 
 		 574 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1583  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.21 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.132729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1023  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.57 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.89 
 
 		 605 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3137  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.64 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0149  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.89 
 
 		 187 aa  42  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  27.18 
 
 		 645 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  30.69 
 
 		 607 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003140  DNA polymerase III epsilon subunit  36.36 
 
 		 239 aa  41.6  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0966  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.14 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.75 
 
 		 715 aa  41.2  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>