116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20630 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20630  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  925    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.548267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0536  chromosome partitioning ATPase  36.36 
 
 		 436 aa  229  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.605125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13170  chromosome partitioning ATPase  30.96 
 
 		 541 aa  191  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.768341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.11 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  25.52 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  25.98 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1035  chromosome partitioning ATPase-like protein  22.34 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  25.43 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.13 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  24.24 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  26.07 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  22.69 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  22.58 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  23.76 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  25.37 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  20.64 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  25.79 
 
 		 537 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.62 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.49 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  24.47 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.28 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  21.45 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  24.34 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.79 
 
 		 275 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  22.55 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  22.03 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  23.76 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  35.29 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  22.86 
 
 		 300 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.08 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  25 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  23.03 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  20.79 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.58 
 
 		 389 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25.46 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  24.76 
 
 		 400 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.03 
 
 		 295 aa  50.1  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 		 295 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 294 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  21.61 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.2 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 391 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.31 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  21.46 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.65 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  27.48 
 
 		 309 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  21.65 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.54 
 
 		 309 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  26.41 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 		 343 aa  47.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.34 
 
 		 293 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.88 
 
 		 301 aa  47.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.39 
 
 		 311 aa  47.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  25.22 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.32 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.76 
 
 		 300 aa  47  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.91 
 
 		 298 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 402 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  23.79 
 
 		 264 aa  47  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2568  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.46 
 
 		 421 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  22.69 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.28 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  22.69 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  23.57 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  22.69 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  22.69 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  28.48 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  22.69 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  22.69 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  22.69 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  22.69 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  25.29 
 
 		 287 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  23.9 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  26.19 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  42.86 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  25 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.52 
 
 		 273 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  24.84 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.22 
 
 		 731 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.32 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.21 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  24.34 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  22.53 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  26.19 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  29.73 
 
 		 281 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.1 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  40.28 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.68 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1418  cell division ATPase MinD  24.56 
 
 		 301 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.986435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.32 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.51 
 
 		 275 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0721  chromosome partitioning ATPase  25.3 
 
 		 238 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>