88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13170 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13170  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
541 aa  1102    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.768341  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0536  chromosome partitioning ATPase  45.45 
 
 
436 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.605125  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20630  hypothetical protein  30.96 
 
 
458 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.548267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  30 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.72 
 
 
295 aa  67  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.72 
 
 
295 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.66 
 
 
275 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 
294 aa  61.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  24.17 
 
 
390 aa  60.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  23.21 
 
 
420 aa  60.5  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  27.23 
 
 
266 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  25.13 
 
 
376 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  21.99 
 
 
430 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.67 
 
 
412 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  25.11 
 
 
416 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 
391 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.63 
 
 
389 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.43 
 
 
291 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.18 
 
 
377 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  24.79 
 
 
400 aa  57  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  21.15 
 
 
430 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  23.05 
 
 
419 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  22.59 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 
278 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.65 
 
 
377 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  24.8 
 
 
416 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.29 
 
 
395 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  26.37 
 
 
397 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2458  chromosome partitioning ATPase  24.86 
 
 
498 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  24.31 
 
 
391 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  22.09 
 
 
400 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  28.8 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.22 
 
 
398 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.48 
 
 
311 aa  51.2  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  26.51 
 
 
537 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  28.65 
 
 
275 aa  50.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  24.07 
 
 
287 aa  50.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.7 
 
 
228 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.7 
 
 
228 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0698  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.06 
 
 
273 aa  50.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.6397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  24.05 
 
 
280 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.13 
 
 
283 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2732  tyrosine kinase  34.68 
 
 
303 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0677811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  24.84 
 
 
309 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.34 
 
 
273 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.84 
 
 
309 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  21.92 
 
 
392 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  26.34 
 
 
289 aa  48.5  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  24.5 
 
 
267 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25 
 
 
419 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  22.96 
 
 
271 aa  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.06 
 
 
262 aa  47.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  22.96 
 
 
274 aa  48.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  29.03 
 
 
781 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  20.09 
 
 
288 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  23.86 
 
 
392 aa  47.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2365  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.89 
 
 
306 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.68 
 
 
519 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  24.55 
 
 
253 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1035  chromosome partitioning ATPase-like protein  24.91 
 
 
432 aa  46.6  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.1 
 
 
296 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.84 
 
 
333 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  33.6 
 
 
403 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  24.26 
 
 
255 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  29.32 
 
 
746 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.54 
 
 
275 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.1 
 
 
296 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.54 
 
 
275 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  29.32 
 
 
746 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  29.32 
 
 
746 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.83 
 
 
454 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.28 
 
 
308 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0736  tyrosine kinase  28.17 
 
 
315 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 
314 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  28.9 
 
 
275 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  25.7 
 
 
276 aa  45.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  27.37 
 
 
358 aa  45.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.11 
 
 
398 aa  44.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  26.98 
 
 
511 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.73 
 
 
290 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.87 
 
 
255 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 
259 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 
259 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.23 
 
 
780 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0366  histidinol phosphatase  23.65 
 
 
288 aa  44.3  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00129205  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  24.73 
 
 
294 aa  43.9  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0244  protein-tyrosine kinase  27.98 
 
 
309 aa  43.5  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.22 
 
 
278 aa  43.5  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>