More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0554 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0554  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
460 aa  944    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0540  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
460 aa  944    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  60.96 
 
 
454 aa  567  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 
466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  37.41 
 
 
466 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  37.64 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
466 aa  306  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
466 aa  306  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
466 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 
466 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
466 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
473 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  38.06 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.62 
 
 
465 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  35.59 
 
 
463 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
466 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
466 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
466 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
466 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.42 
 
 
464 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  36.58 
 
 
466 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 
466 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.41 
 
 
472 aa  276  8e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 
471 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
473 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 
463 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  33.55 
 
 
464 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  34.71 
 
 
463 aa  253  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 
479 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  33.76 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.53 
 
 
486 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
496 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
459 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
484 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  31.26 
 
 
490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  30.47 
 
 
476 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05334  transcriptional regulator  31.84 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.28 
 
 
473 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.42 
 
 
474 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
444 aa  216  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.81 
 
 
472 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
503 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
480 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  29.87 
 
 
488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.68 
 
 
593 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.19 
 
 
444 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.19 
 
 
444 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
444 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 
470 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  27 
 
 
520 aa  213  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  27.12 
 
 
485 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.72 
 
 
497 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.87 
 
 
491 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
485 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.72 
 
 
471 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.23 
 
 
485 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
485 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  28.78 
 
 
509 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
493 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
485 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  30.28 
 
 
498 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.1 
 
 
485 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13610  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  29.57 
 
 
509 aa  207  4e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
475 aa  207  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.11 
 
 
497 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  31.42 
 
 
501 aa  207  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
501 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.91 
 
 
509 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 
517 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
501 aa  205  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.19 
 
 
485 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  28.6 
 
 
473 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
492 aa  203  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
480 aa  203  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  30.99 
 
 
488 aa  203  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.53 
 
 
501 aa  202  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.77 
 
 
514 aa  202  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
496 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  26.25 
 
 
520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  30.66 
 
 
504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000554  transcriptional regulator GntR family/aminotransferase class-i  31.14 
 
 
481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  29.04 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
490 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  29.36 
 
 
491 aa  201  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2189  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
499 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199182  hitchhiker  0.00899301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.14 
 
 
500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
507 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.82 
 
 
501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  27.88 
 
 
509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.17 
 
 
489 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  26.75 
 
 
478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>