191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3478 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  100 
 
 		 141 aa  290  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  64.44 
 
 		 137 aa  183  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  63.64 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  61.03 
 
 		 137 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  54.26 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  52.24 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  46.21 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  45.11 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  41.22 
 
 		 140 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  46.21 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 		 838 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  39.53 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  42.48 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  39.67 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  36.64 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  40.68 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.6 
 
 		 367 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  38.52 
 
 		 370 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  36.44 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  35.38 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  39.34 
 
 		 371 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.43 
 
 		 371 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  36.29 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.04 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1717  globin  29.93 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  37.5 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  32.28 
 
 		 377 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.65 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46237  predicted protein  33.83 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  28.03 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  26.76 
 
 		 398 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  35.54 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  32.76 
 
 		 403 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  30.08 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  30.08 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.9 
 
 		 372 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  26.32 
 
 		 426 aa  63.5  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.76 
 
 		 379 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  27.61 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  27.61 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  35.58 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.63 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  26.52 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.97 
 
 		 399 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  26.57 
 
 		 410 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  30.3 
 
 		 393 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  29.52 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  25.95 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  27.36 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  32.43 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  27.56 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  29.2 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  27.41 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  28.3 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.48 
 
 		 383 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.41 
 
 		 407 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  30.58 
 
 		 401 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  27.66 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.67 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  25.76 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  29.46 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  25.76 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  29.17 
 
 		 401 aa  55.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  25.76 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  25.76 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  24.24 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  32.2 
 
 		 395 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  29.55 
 
 		 396 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.52 
 
 		 428 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  25.9 
 
 		 402 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  27.07 
 
 		 393 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.9 
 
 		 395 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  29.81 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  25.76 
 
 		 396 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  25.69 
 
 		 402 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  26.52 
 
 		 396 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  30 
 
 		 394 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  31.25 
 
 		 399 aa  52  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  29.46 
 
 		 429 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  27.07 
 
 		 393 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.58 
 
 		 401 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.57 
 
 		 406 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.58 
 
 		 401 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.4 
 
 		 382 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  25.35 
 
 		 402 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  25.35 
 
 		 402 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  25.35 
 
 		 402 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  25.35 
 
 		 402 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 		 396 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  25.35 
 
 		 402 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  25.35 
 
 		 402 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  24.24 
 
 		 397 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  24.24 
 
 		 397 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  25.71 
 
 		 403 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  25.35 
 
 		 402 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  24.24 
 
 		 396 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 393 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  25 
 
 		 395 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  24.24 
 
 		 396 aa  50.4  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 		 402 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>