135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3055 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3055  globin  100 
 
 		 133 aa  261  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  39.53 
 
 		 140 aa  95.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 		 838 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  38.46 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  34.43 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  37.5 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  35.61 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  36.29 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  34.68 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  36.43 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  35.04 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  31.54 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  34.88 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  30.77 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  35.38 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.87 
 
 		 367 aa  68.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.85 
 
 		 371 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  36.46 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  36.15 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  23.62 
 
 		 394 aa  61.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  29.69 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  31.15 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  23.66 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  22.96 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.58 
 
 		 370 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  34.95 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.33 
 
 		 407 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.45 
 
 		 383 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  28.28 
 
 		 396 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.51 
 
 		 372 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  34.88 
 
 		 371 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  27.73 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  27.73 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  22.22 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  25.37 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  22.9 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  22.9 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  22.22 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  22.9 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  22.9 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.05 
 
 		 394 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  27.91 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.79 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2776  Nitric oxide dioxygenase  30.95 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  23.66 
 
 		 395 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  25.38 
 
 		 397 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  25.38 
 
 		 397 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  20.16 
 
 		 398 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  34.31 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  25.98 
 
 		 215 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  22.14 
 
 		 397 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  22.14 
 
 		 397 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  33.01 
 
 		 368 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  27.87 
 
 		 403 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  22.79 
 
 		 396 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  21.37 
 
 		 396 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  21.37 
 
 		 396 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  22.39 
 
 		 397 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  23.44 
 
 		 396 aa  50.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  21.37 
 
 		 396 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.48 
 
 		 399 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  24.24 
 
 		 393 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  27.43 
 
 		 403 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6268  Nitric oxide synthase NOS  24.81 
 
 		 1524 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.25 
 
 		 482 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  19.85 
 
 		 396 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  24.8 
 
 		 411 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.1 
 
 		 379 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1717  globin  25.66 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  25.78 
 
 		 377 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.25 
 
 		 383 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  19.85 
 
 		 396 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  24.06 
 
 		 400 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  24.22 
 
 		 393 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  21.21 
 
 		 394 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  23.62 
 
 		 393 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.97 
 
 		 382 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1757  flavohemoprotein, truncation  22.4 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  21.71 
 
 		 393 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  29.03 
 
 		 429 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  18.8 
 
 		 396 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  28.3 
 
 		 403 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  28.57 
 
 		 413 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1527  conserved hypothetical protein, putative flavohemoprotein  21.77 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1574  flavohemoprotein, truncation  22.4 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  18.05 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  18.05 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  25.95 
 
 		 402 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  18.05 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  22.56 
 
 		 393 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  18.05 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  18.05 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  18.05 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  18.05 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  24.41 
 
 		 393 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  18.05 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  18.05 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  18.32 
 
 		 396 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  18.32 
 
 		 396 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>