152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0806 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0806  globin  100 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  46.92 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  45 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  42.96 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  42.54 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  40.74 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  39.53 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  41.09 
 
 		 137 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  39.53 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  39.53 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 		 838 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  39.71 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  37.3 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  34.62 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  32.09 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  30.95 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.62 
 
 		 367 aa  77  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.54 
 
 		 371 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.18 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  36.43 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  32.79 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  35.71 
 
 		 371 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  27.61 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.94 
 
 		 407 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  28.57 
 
 		 426 aa  60.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 390 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.4 
 
 		 370 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  27.61 
 
 		 394 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  29.1 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  29.1 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1717  globin  23.85 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  24.77 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.17 
 
 		 379 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  30.28 
 
 		 396 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  29.37 
 
 		 403 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.46 
 
 		 372 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  29.25 
 
 		 403 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  21.48 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 368 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  25.93 
 
 		 396 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  24.63 
 
 		 398 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  31.39 
 
 		 395 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3526  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.47 
 
 		 416 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  27.13 
 
 		 377 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3654  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.81 
 
 		 412 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0203776  normal  0.336009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 396 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  24.06 
 
 		 400 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2229  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.71 
 
 		 409 aa  50.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  24.81 
 
 		 396 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  28.18 
 
 		 394 aa  50.8  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  23.31 
 
 		 394 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  24.81 
 
 		 396 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  28.97 
 
 		 429 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25 
 
 		 399 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.36 
 
 		 394 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  24.06 
 
 		 396 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  30.28 
 
 		 400 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  23.88 
 
 		 396 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  23.88 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.88 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  23.88 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  25.37 
 
 		 397 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  24.06 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  23.88 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  23.88 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  23.88 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  23.88 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  24.06 
 
 		 396 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  23.88 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  24.06 
 
 		 396 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  24.06 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  23.88 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  23.85 
 
 		 411 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  23.31 
 
 		 396 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  23.31 
 
 		 396 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  25.74 
 
 		 410 aa  47.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0325  flavohemoprotein, putative  21.05 
 
 		 381 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.63 
 
 		 399 aa  47.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  24.81 
 
 		 395 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  25.56 
 
 		 397 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  23.31 
 
 		 396 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  25.56 
 
 		 397 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 		 398 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  25.56 
 
 		 397 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  25.56 
 
 		 397 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0148  globin  29.91 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  29.77 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.89 
 
 		 482 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  25 
 
 		 402 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45621  predicted protein  31.82 
 
 		 426 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.690367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.1 
 
 		 406 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  25.56 
 
 		 397 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  28.04 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  24.46 
 
 		 403 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  23.31 
 
 		 409 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  23.88 
 
 		 402 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  25.56 
 
 		 397 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  23.88 
 
 		 402 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  24.56 
 
 		 422 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  23.48 
 
 		 393 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>