More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0577 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
371 aa  747    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50.4 
 
 
379 aa  325  6e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  50.53 
 
 
368 aa  314  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.87 
 
 
372 aa  301  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.57 
 
 
482 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.34 
 
 
367 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.43 
 
 
394 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  39.52 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.26 
 
 
383 aa  252  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  42.7 
 
 
377 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.51 
 
 
407 aa  248  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  37.47 
 
 
390 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.03 
 
 
372 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  37.89 
 
 
403 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.87 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0470  oxidoreductase FAD-binding region  37.64 
 
 
388 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0481  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.64 
 
 
388 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.29 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10390  hypothetical protein  37.23 
 
 
425 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0586534  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.46 
 
 
383 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0639  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.52 
 
 
388 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.83 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  43.61 
 
 
153 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  43.61 
 
 
153 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.81 
 
 
382 aa  116  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  45.24 
 
 
141 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8375  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.44 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
838 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.54 
 
 
346 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  45.08 
 
 
140 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0984  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.18 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386753 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0860  iron-sulfur cluster-binding protein/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  33.18 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.451181  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  37.8 
 
 
127 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  40.31 
 
 
135 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.88 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  25.89 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  24.11 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  24.47 
 
 
394 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  25.78 
 
 
396 aa  93.2  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  41.46 
 
 
139 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  36.57 
 
 
140 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  25.71 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.71 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3559  p-cymene monooxygenase, reductase subunit(CymAb)  34.8 
 
 
349 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393821  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  25.71 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  25.71 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  25.71 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  25.71 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  25.71 
 
 
396 aa  89.7  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.66 
 
 
345 aa  89.7  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  22.73 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  34.13 
 
 
140 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  22.73 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  25.46 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  22.73 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  25.45 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.99 
 
 
342 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2749  putative flavodoxin oxidoreductase  32.54 
 
 
334 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  37.8 
 
 
157 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  27.31 
 
 
397 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  24.87 
 
 
393 aa  86.3  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.9 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.49 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  23.69 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  29.36 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  24.67 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.51 
 
 
752 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.67 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  23.42 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  25.68 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  25.46 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  24.24 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2053  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.06 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000007683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.31 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.48 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.68 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  26.57 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.77 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  28.31 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  24.19 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.49 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.42 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  24.15 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  24.53 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.84 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  24.41 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  24.28 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.74 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  27 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4366  FMN reductase  32.66 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.783355  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.32 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.73 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  26.52 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  34.96 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.1 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>