More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2227 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 		 379 aa  757    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  50.4 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  50.54 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  52.19 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.66 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.61 
 
 		 482 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.58 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  45.15 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  43.06 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  48.06 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  43.18 
 
 		 370 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.39 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  41.6 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  42.94 
 
 		 403 aa  255  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.25 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0470  oxidoreductase FAD-binding region  35.28 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0481  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.28 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.2 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.01 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.25 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0639  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.15 
 
 		 388 aa  172  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10390  hypothetical protein  35.79 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0586534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.56 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0860  iron-sulfur cluster-binding protein/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  30.87 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.451181  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0984  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.87 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.95 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  25.87 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  28.05 
 
 		 393 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.39 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  24.74 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  24.17 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  23.62 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.8 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8375  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.03 
 
 		 437 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  24.6 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  24.56 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  22.59 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  22.92 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  23.19 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  22.63 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  24.37 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.37 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  24.37 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  24.37 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  24.37 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  24.37 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  24.37 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  24.37 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  24.68 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  36.84 
 
 		 153 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  22.34 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  22.34 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  36.84 
 
 		 153 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  22.34 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  22.37 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  22.34 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  22.34 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  24.11 
 
 		 396 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  22.34 
 
 		 402 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2053  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.34 
 
 		 229 aa  97.1  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000007683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.85 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  25.44 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  25.27 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  25.27 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  27.76 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.48 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  25.27 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  25.93 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  22.17 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  23.37 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  23.37 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  22.47 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  23.13 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  23.13 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  36.43 
 
 		 141 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  25.13 
 
 		 403 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  22.47 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  40.48 
 
 		 140 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  24.67 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.47 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  23.14 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  35.6 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  38.1 
 
 		 127 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  27.23 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  22.22 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  23.13 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  26.12 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.54 
 
 		 251 aa  91.3  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  26.98 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.34 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  23.48 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  24.54 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  22.73 
 
 		 397 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  31.85 
 
 		 678 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.8 
 
 		 681 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  22.99 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  31.6 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.05 
 
 		 678 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2668  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.44 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.8 
 
 		 678 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>