194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0861 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0985  globin  100 
 
 		 153 aa  320  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  100 
 
 		 153 aa  320  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.61 
 
 		 371 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.14 
 
 		 372 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  40 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  36.69 
 
 		 368 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.32 
 
 		 482 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  38.64 
 
 		 377 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  37.6 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.6 
 
 		 383 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.81 
 
 		 367 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.32 
 
 		 379 aa  97.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  35.66 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  35.61 
 
 		 371 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  34.81 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  33.09 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  33.09 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 		 838 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  34.09 
 
 		 400 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  35.71 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  34.35 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  38.33 
 
 		 400 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 390 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  35.11 
 
 		 397 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  34.85 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  35.11 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  34.85 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.47 
 
 		 407 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.24 
 
 		 370 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.63 
 
 		 394 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  32.84 
 
 		 396 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.66 
 
 		 399 aa  80.9  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  32.82 
 
 		 396 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  32.82 
 
 		 396 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  34.09 
 
 		 397 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  34.09 
 
 		 397 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  32.58 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  33.06 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  34.19 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.31 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.34 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  31.5 
 
 		 403 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  34.15 
 
 		 396 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.15 
 
 		 396 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  34.15 
 
 		 396 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  34.15 
 
 		 396 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  34.62 
 
 		 397 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  34.15 
 
 		 396 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  34.15 
 
 		 396 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  34.44 
 
 		 393 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  34.15 
 
 		 396 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  34.15 
 
 		 396 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  34.15 
 
 		 396 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  31.29 
 
 		 396 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  34.75 
 
 		 396 aa  78.2  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  31.29 
 
 		 396 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  31.29 
 
 		 396 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  31.29 
 
 		 396 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  31.29 
 
 		 396 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  32.06 
 
 		 396 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  32.06 
 
 		 396 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  26.47 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.33 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  29.2 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  33.59 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  30.83 
 
 		 396 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  29.77 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  33.06 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  31.09 
 
 		 215 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 		 402 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  30.61 
 
 		 402 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  32.09 
 
 		 411 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  30.53 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  34.65 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  31.3 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  32.82 
 
 		 394 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  30.61 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  29.41 
 
 		 402 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  29.93 
 
 		 402 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  29.93 
 
 		 399 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  34.09 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.92 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.41 
 
 		 402 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  27.61 
 
 		 398 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  29.93 
 
 		 402 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.08 
 
 		 406 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  29.41 
 
 		 402 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  29.93 
 
 		 402 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  29.93 
 
 		 402 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  29.93 
 
 		 402 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  32.54 
 
 		 403 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  29.37 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  29.41 
 
 		 402 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  32.17 
 
 		 396 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.76 
 
 		 402 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  34.78 
 
 		 393 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  33.33 
 
 		 402 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.01 
 
 		 403 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  31.39 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  33.57 
 
 		 393 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>