163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4229 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4229  globin  100 
 
 		 146 aa  300  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  60.71 
 
 		 152 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  53.44 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  45.93 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  42.14 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  41.43 
 
 		 141 aa  116  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  41.54 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  38.39 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  39.1 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  40.31 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.76 
 
 		 838 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  37.21 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  34.09 
 
 		 377 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  34.62 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  35.38 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  37.07 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  30.16 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  34.35 
 
 		 390 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.82 
 
 		 367 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  34.62 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  31.3 
 
 		 403 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  26.47 
 
 		 153 aa  76.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  26.47 
 
 		 153 aa  76.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.38 
 
 		 379 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.58 
 
 		 371 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.32 
 
 		 394 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.09 
 
 		 407 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  36.72 
 
 		 371 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  33.08 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.77 
 
 		 372 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  35.38 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.53 
 
 		 372 aa  68.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.23 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  26.12 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.82 
 
 		 482 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 400 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  26.62 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  27.61 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  23.88 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  26.62 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  26.62 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  26.62 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  26.62 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  28.68 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  26.62 
 
 		 402 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  23.13 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.21 
 
 		 402 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  27.91 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.91 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.91 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.94 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  28.12 
 
 		 402 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  27.21 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  27.21 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.21 
 
 		 383 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  25.18 
 
 		 402 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  26.17 
 
 		 394 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  22.39 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  33.63 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.79 
 
 		 388 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  24.81 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.81 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  24.81 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  24.81 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  24.81 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  24.81 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  24.81 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  24.81 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  24.81 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0470  oxidoreductase FAD-binding region  32.79 
 
 		 388 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0481  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.79 
 
 		 388 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  24.81 
 
 		 396 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  27.21 
 
 		 400 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  24.81 
 
 		 396 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.33 
 
 		 383 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  26.71 
 
 		 413 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.84 
 
 		 380 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  24.44 
 
 		 411 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  27.93 
 
 		 393 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2776  Nitric oxide dioxygenase  29.69 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  25.37 
 
 		 396 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  24.82 
 
 		 414 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  24.06 
 
 		 396 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 402 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  24.06 
 
 		 396 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  24.06 
 
 		 396 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  31.19 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  26.28 
 
 		 414 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  26.77 
 
 		 403 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 402 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  24.06 
 
 		 396 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  24.06 
 
 		 396 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 402 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  24.43 
 
 		 397 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>