34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0084 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0084  globin  100 
 
 		 178 aa  373  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  37.07 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  37.84 
 
 		 135 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  36.84 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  35.14 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 838 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  36.36 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  35.54 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  31.54 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  32.54 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  36.28 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  30.91 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  31.71 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  28.23 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  29.91 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  30.83 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.28 
 
 		 367 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  31.3 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  32.95 
 
 		 133 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0639  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.7 
 
 		 388 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.33 
 
 		 370 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  25.55 
 
 		 177 aa  44.3  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46237  predicted protein  25.42 
 
 		 202 aa  44.3  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.27 
 
 		 380 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.86 
 
 		 383 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  26.67 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 368 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  27.78 
 
 		 371 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.71 
 
 		 394 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  28.32 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  21.88 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  21.88 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  29.49 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  31.53 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>