More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6945 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 
367 aa  754    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  55.49 
 
 
370 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.59 
 
 
482 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  46.41 
 
 
371 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  41.39 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  41.42 
 
 
403 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.69 
 
 
372 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0470  oxidoreductase FAD-binding region  43.6 
 
 
388 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0481  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.6 
 
 
388 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.87 
 
 
388 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.98 
 
 
379 aa  295  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  43.06 
 
 
377 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.58 
 
 
380 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.78 
 
 
383 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10390  hypothetical protein  42.08 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0586534  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.27 
 
 
372 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0639  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.21 
 
 
388 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.76 
 
 
394 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  42.11 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.34 
 
 
371 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.4 
 
 
407 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.45 
 
 
383 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.43 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0860  iron-sulfur cluster-binding protein/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  33.48 
 
 
327 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.451181  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0984  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.48 
 
 
330 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8375  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.81 
 
 
437 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  29.74 
 
 
393 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3559  p-cymene monooxygenase, reductase subunit(CymAb)  31.8 
 
 
349 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393821  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.92 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  33.77 
 
 
342 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.48 
 
 
333 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  40.16 
 
 
127 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  25.12 
 
 
402 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3237  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.48 
 
 
333 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  29.29 
 
 
350 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  27.5 
 
 
411 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  26.8 
 
 
393 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  26.02 
 
 
402 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.63 
 
 
346 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  25.45 
 
 
403 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32 
 
 
354 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  25.13 
 
 
399 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.09 
 
 
354 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.29 
 
 
752 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  27.02 
 
 
402 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  27.02 
 
 
402 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.68 
 
 
354 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  27.02 
 
 
402 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.68 
 
 
354 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  26.67 
 
 
402 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  27.02 
 
 
402 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  26.67 
 
 
402 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  27.02 
 
 
402 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  27.02 
 
 
402 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  26.21 
 
 
409 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  27.02 
 
 
402 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  27.02 
 
 
402 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  25.58 
 
 
411 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.23 
 
 
403 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2508  oxygenase, putative  28.7 
 
 
324 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663767  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.55 
 
 
342 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.43 
 
 
365 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.77 
 
 
343 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.72 
 
 
328 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 
838 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.1 
 
 
372 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.85 
 
 
398 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.61 
 
 
340 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4410  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.92 
 
 
376 aa  99.8  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.421266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  30 
 
 
353 aa  99.4  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.36 
 
 
353 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.14 
 
 
342 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.27 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.87 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1799  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.33 
 
 
336 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  34.81 
 
 
153 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  34.81 
 
 
153 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  38.93 
 
 
141 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.28 
 
 
328 aa  97.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  36.92 
 
 
135 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  26.13 
 
 
403 aa  96.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.42 
 
 
399 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  25.75 
 
 
403 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  30.8 
 
 
356 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  25.63 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  25.26 
 
 
413 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.77 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  29.31 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2749  putative flavodoxin oxidoreductase  32.13 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  29.79 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1122  oxidoreductase  31.06 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14183  normal  0.242287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0164  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.07 
 
 
331 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000937839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.6 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.09 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  35.16 
 
 
142 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2280  phenol hydrolase reductase  30.32 
 
 
352 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.82 
 
 
345 aa  94  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  27.39 
 
 
400 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.39 
 
 
400 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.96 
 
 
343 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>