188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0607 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0607  globin  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.2 
 
 		 838 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  59.69 
 
 		 140 aa  156  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  55.04 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  55.38 
 
 		 137 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  52.24 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  50.77 
 
 		 137 aa  137  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  52.31 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  50 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  49.61 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  43.7 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  47.37 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  50.37 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  40.74 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  42.86 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  38.76 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.31 
 
 		 371 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  39.1 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.92 
 
 		 367 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  35.66 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  35.66 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1717  globin  33.33 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.19 
 
 		 370 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  36.51 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.91 
 
 		 372 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  35.07 
 
 		 400 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  40.31 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  37.21 
 
 		 390 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.26 
 
 		 394 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.78 
 
 		 407 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  38.46 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.12 
 
 		 379 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.19 
 
 		 482 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  37.84 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  32.81 
 
 		 377 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  31.3 
 
 		 403 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  27.61 
 
 		 400 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  34.21 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  29.1 
 
 		 410 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.53 
 
 		 372 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  29.1 
 
 		 426 aa  63.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  33.01 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  27.82 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0639  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.58 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  27.82 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.65 
 
 		 383 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32831  hypothetical protein  31.73 
 
 		 348 aa  61.6  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  28.57 
 
 		 403 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  33.93 
 
 		 429 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  30.63 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  29.1 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0470  oxidoreductase FAD-binding region  34.51 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0481  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.51 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.04 
 
 		 399 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.58 
 
 		 380 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  27.78 
 
 		 396 aa  57  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.63 
 
 		 388 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  27.78 
 
 		 396 aa  57  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  27.78 
 
 		 396 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.78 
 
 		 396 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  27.78 
 
 		 396 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  27.78 
 
 		 396 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  27.78 
 
 		 396 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  27.78 
 
 		 396 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  27.78 
 
 		 396 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  23.48 
 
 		 396 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.41 
 
 		 402 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  27.41 
 
 		 402 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  25.19 
 
 		 394 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.14 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  26.85 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  29.46 
 
 		 403 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  24.53 
 
 		 398 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  26.85 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  26.85 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  26.85 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  24.22 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  26.85 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  26.85 
 
 		 396 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  27.78 
 
 		 394 aa  54.7  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.93 
 
 		 402 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  30.56 
 
 		 402 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  26.85 
 
 		 396 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  25.93 
 
 		 402 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  25.93 
 
 		 402 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.93 
 
 		 402 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  26.12 
 
 		 402 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  25.93 
 
 		 396 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10390  hypothetical protein  33.09 
 
 		 425 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0586534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  30.6 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  26.85 
 
 		 394 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46237  predicted protein  25.55 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  25 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.97 
 
 		 383 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  30.77 
 
 		 401 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  25.19 
 
 		 402 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  25.19 
 
 		 402 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  25.19 
 
 		 402 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  25.19 
 
 		 399 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>