43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32831 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_32831  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  720    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168677  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67553  hypothetical protein  25.29 
 
 
850 aa  67.4  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00659474  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  31.62 
 
 
135 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  29.81 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.44 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  27.88 
 
 
137 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  23.58 
 
 
127 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  27.62 
 
 
141 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  24.2 
 
 
379 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  27.88 
 
 
137 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  23.39 
 
 
407 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  25.21 
 
 
215 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  25.45 
 
 
410 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  26.67 
 
 
140 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 
838 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  25.86 
 
 
140 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  25 
 
 
377 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  25 
 
 
152 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  22.07 
 
 
396 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  23.73 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  23.73 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  23.73 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  23.73 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  23.73 
 
 
397 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  23.73 
 
 
397 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  26.92 
 
 
141 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  25 
 
 
153 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  25 
 
 
153 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.74 
 
 
383 aa  46.2  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  27.88 
 
 
137 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  22.22 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  24.82 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.42 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.53 
 
 
482 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.34 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  23.93 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  27.72 
 
 
148 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.52 
 
 
428 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  22.86 
 
 
390 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  26.55 
 
 
393 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  26.67 
 
 
140 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  23.64 
 
 
399 aa  42.7  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>