173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1757 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1757  globin  100 
 
 		 152 aa  310  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  60.71 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  53.44 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  48.15 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  46.27 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  43.85 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  43.7 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  44.78 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.41 
 
 		 838 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  36.22 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  40.34 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  44.44 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  36.15 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  38.14 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  40.68 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  36.64 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.43 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  32.09 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  33.33 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.45 
 
 		 371 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  33.33 
 
 		 377 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.63 
 
 		 372 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  35.14 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.23 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.51 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  37.61 
 
 		 390 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  35.78 
 
 		 403 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  30.08 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1717  globin  30.65 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 368 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.06 
 
 		 407 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  28.7 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  28.7 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.45 
 
 		 394 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  36.8 
 
 		 371 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.94 
 
 		 372 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.57 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  31.19 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  30.84 
 
 		 394 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  31.03 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  25.93 
 
 		 400 aa  60.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  28.89 
 
 		 414 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  27.1 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 423 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  28.28 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.17 
 
 		 380 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 414 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  28.89 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  30.97 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.05 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  27.07 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0470  oxidoreductase FAD-binding region  33.05 
 
 		 388 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0481  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.05 
 
 		 388 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0909  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357631  normal  0.205289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.35 
 
 		 403 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  29.1 
 
 		 400 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  29.73 
 
 		 394 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  28.89 
 
 		 393 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  26.67 
 
 		 411 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  29.73 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.73 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.28 
 
 		 406 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  29.73 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  29.73 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  29.73 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0639  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.36 
 
 		 388 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  29.73 
 
 		 396 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  30.09 
 
 		 403 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.25 
 
 		 383 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  29.73 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  29.73 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  29.73 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  29.73 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  23.94 
 
 		 426 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  30.28 
 
 		 429 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  26.87 
 
 		 397 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  26.87 
 
 		 397 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2776  Nitric oxide dioxygenase  34 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.73 
 
 		 393 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  27.68 
 
 		 397 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  29.73 
 
 		 394 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.44 
 
 		 383 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.44 
 
 		 403 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2494  globin  27.12 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  31.48 
 
 		 401 aa  50.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  27.93 
 
 		 396 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  27.48 
 
 		 395 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  27.93 
 
 		 396 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  26.17 
 
 		 396 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  26.17 
 
 		 396 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  28.83 
 
 		 396 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  28.83 
 
 		 396 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  28.83 
 
 		 396 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46237  predicted protein  29.66 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  26.17 
 
 		 396 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  25.93 
 
 		 414 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  27.1 
 
 		 397 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  28.83 
 
 		 396 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  27.1 
 
 		 397 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  27.1 
 
 		 397 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>