More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88330 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  100 
 
 
401 aa  825    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  40.86 
 
 
393 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  39.8 
 
 
392 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  39.8 
 
 
392 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  39.8 
 
 
392 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  39.39 
 
 
393 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  39.49 
 
 
393 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  39.29 
 
 
393 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  38.13 
 
 
393 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  38.01 
 
 
393 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  40.5 
 
 
393 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  39.14 
 
 
408 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  36.96 
 
 
392 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.68 
 
 
393 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  36.64 
 
 
393 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  38.73 
 
 
393 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  40.3 
 
 
419 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  39.24 
 
 
393 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.93 
 
 
394 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.71 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  36.34 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  34.68 
 
 
393 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  32.74 
 
 
393 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  35.32 
 
 
398 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  34.34 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  34 
 
 
402 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.92 
 
 
402 aa  212  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.67 
 
 
403 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  35.05 
 
 
402 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.75 
 
 
402 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  34.18 
 
 
394 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  33.83 
 
 
403 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  33.75 
 
 
402 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  34.8 
 
 
402 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  35.18 
 
 
396 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  34.8 
 
 
402 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  34.8 
 
 
402 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  33.25 
 
 
402 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  34.8 
 
 
402 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  34.8 
 
 
402 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  33.25 
 
 
402 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  35.93 
 
 
402 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  33.5 
 
 
399 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  34.8 
 
 
402 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  34.57 
 
 
402 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  33.58 
 
 
402 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  32.47 
 
 
395 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  33.73 
 
 
394 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  35.11 
 
 
397 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  35.11 
 
 
397 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  33.91 
 
 
403 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  35.18 
 
 
402 aa  206  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  33 
 
 
402 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  33.33 
 
 
402 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  33 
 
 
402 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  33 
 
 
402 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  33 
 
 
402 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  34.02 
 
 
397 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  33.25 
 
 
402 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  34.58 
 
 
402 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.08 
 
 
402 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  33.25 
 
 
402 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1514  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.92 
 
 
402 aa  203  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.156255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.32 
 
 
399 aa  203  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  33.76 
 
 
397 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  34.35 
 
 
397 aa  203  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.82 
 
 
408 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  33.76 
 
 
397 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  33.42 
 
 
397 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  32.53 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  34.16 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  32.6 
 
 
409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  32.51 
 
 
403 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  31.02 
 
 
400 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  32.49 
 
 
397 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  32.49 
 
 
397 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  32.17 
 
 
396 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  32.17 
 
 
396 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  32.17 
 
 
396 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  32 
 
 
399 aa  192  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07160  response to stress-related protein, putative  31.13 
 
 
504 aa  190  4e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  30.67 
 
 
396 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  33.91 
 
 
411 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  33.5 
 
 
396 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  30.38 
 
 
426 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.22 
 
 
428 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  31.51 
 
 
414 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  30.25 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  32.05 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  32.41 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  30.92 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  30.92 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.92 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  30.92 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  30.92 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  30.92 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  30.92 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  30.92 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  31.2 
 
 
410 aa  182  8.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>