More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4950 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
372 aa  751    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  58.42 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  52.16 
 
 
379 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.87 
 
 
371 aa  301  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  48.4 
 
 
368 aa  295  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.51 
 
 
482 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.27 
 
 
367 aa  282  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  45.03 
 
 
371 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  41.48 
 
 
377 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  41.41 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.95 
 
 
407 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  38.42 
 
 
403 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  39.14 
 
 
390 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.86 
 
 
372 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.78 
 
 
394 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.97 
 
 
383 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0470  oxidoreductase FAD-binding region  34.86 
 
 
388 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0481  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.86 
 
 
388 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.41 
 
 
388 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.93 
 
 
380 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0639  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.07 
 
 
388 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10390  hypothetical protein  37.1 
 
 
425 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0586534  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.34 
 
 
382 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0860  iron-sulfur cluster-binding protein/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  34.06 
 
 
327 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.451181  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0984  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.06 
 
 
330 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  28.57 
 
 
402 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8375  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 
437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  26.5 
 
 
396 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  26.5 
 
 
396 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  26.5 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  25.82 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  44.14 
 
 
153 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  44.14 
 
 
153 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.18 
 
 
394 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.6 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.79 
 
 
353 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  24.42 
 
 
394 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  25.95 
 
 
403 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2966  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.2 
 
 
354 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0998683  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.31 
 
 
346 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.21 
 
 
328 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  25.94 
 
 
396 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.94 
 
 
396 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  25.94 
 
 
396 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  25.94 
 
 
396 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  25.94 
 
 
396 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  25.94 
 
 
396 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  25.94 
 
 
396 aa  106  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  26.25 
 
 
403 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  25.94 
 
 
396 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  26.12 
 
 
396 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  26.62 
 
 
403 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  25.69 
 
 
396 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  25.88 
 
 
409 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.51 
 
 
354 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  25.46 
 
 
397 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.36 
 
 
354 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  34.08 
 
 
342 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1799  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.25 
 
 
336 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  31.44 
 
 
327 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  26.82 
 
 
397 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2749  putative flavodoxin oxidoreductase  30.62 
 
 
334 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  27.39 
 
 
393 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.23 
 
 
353 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  26.91 
 
 
393 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.03 
 
 
354 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  26.82 
 
 
397 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.03 
 
 
354 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  26.44 
 
 
402 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1091  ferredoxin oxidoreductase protein  31.58 
 
 
328 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  26.87 
 
 
397 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.43 
 
 
342 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  36.84 
 
 
334 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  23.62 
 
 
400 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  23.44 
 
 
394 aa  99.8  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  24.63 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  24.63 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  24.38 
 
 
396 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  25.33 
 
 
394 aa  99.4  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.02 
 
 
337 aa  99.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  26.33 
 
 
402 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  30.3 
 
 
356 aa  99.4  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  24.13 
 
 
400 aa  99.4  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  24.25 
 
 
396 aa  99.4  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  26.49 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.71 
 
 
332 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  24.38 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  25.72 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  24.38 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  27.66 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.23 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.21 
 
 
354 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0164  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.73 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000937839 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.83 
 
 
346 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  25.65 
 
 
402 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  25.92 
 
 
402 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.43 
 
 
343 aa  96.3  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2280  phenol hydrolase reductase  29 
 
 
352 aa  95.9  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  23.41 
 
 
396 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  25.92 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>