More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  100 
 
 
370 aa  746    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  55.49 
 
 
367 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.22 
 
 
482 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.75 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.11 
 
 
383 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.69 
 
 
372 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.02 
 
 
380 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10390  hypothetical protein  41.56 
 
 
425 aa  249  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0586534  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0639  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.05 
 
 
388 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  40.87 
 
 
368 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  37.87 
 
 
403 aa  247  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0470  oxidoreductase FAD-binding region  40.92 
 
 
388 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0481  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.92 
 
 
388 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.87 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.19 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  38.95 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  40.12 
 
 
390 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.8 
 
 
394 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  38.48 
 
 
377 aa  232  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.15 
 
 
371 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.24 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.15 
 
 
383 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.98 
 
 
382 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0860  iron-sulfur cluster-binding protein/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  31.49 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.451181  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0984  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.49 
 
 
330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386753 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.73 
 
 
752 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.93 
 
 
346 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8375  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.65 
 
 
437 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  31.47 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.24 
 
 
335 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  32.46 
 
 
343 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  27.44 
 
 
409 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1799  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.11 
 
 
336 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  27.97 
 
 
411 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  33.47 
 
 
342 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  28.12 
 
 
411 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.26 
 
 
848 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  30.21 
 
 
350 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  24.67 
 
 
402 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  30.2 
 
 
336 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.7 
 
 
344 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.46 
 
 
340 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  27.69 
 
 
422 aa  100  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  24.74 
 
 
393 aa  99.8  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  25.66 
 
 
402 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  25.33 
 
 
402 aa  99.4  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.68 
 
 
403 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  31.36 
 
 
336 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.8 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  24.67 
 
 
402 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.98 
 
 
343 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  26.15 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  25.68 
 
 
394 aa  96.7  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  24.14 
 
 
402 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  24.14 
 
 
402 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  24.14 
 
 
402 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  24.14 
 
 
402 aa  95.9  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.36 
 
 
339 aa  95.9  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.62 
 
 
343 aa  96.3  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  24.14 
 
 
402 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  24.16 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3237  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.26 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2966  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.57 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0998683  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.26 
 
 
343 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  24.14 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  38.94 
 
 
127 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  28.78 
 
 
348 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.8 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.29 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  25.36 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  25.6 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  26.79 
 
 
413 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.87 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  27.18 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2723  anthranilate dioxygenase reductase  28 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  27.93 
 
 
402 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.37 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  31.25 
 
 
341 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.04 
 
 
328 aa  94  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.34 
 
 
337 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.24 
 
 
354 aa  93.6  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.13 
 
 
333 aa  93.6  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  25.33 
 
 
403 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.64 
 
 
354 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.64 
 
 
354 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.47 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.83 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  24.87 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  23.86 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.41 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.36 
 
 
337 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  24.47 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.52 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  24.47 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  24.47 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.19 
 
 
881 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.06 
 
 
343 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  25.83 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  32.19 
 
 
881 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.02 
 
 
351 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>