More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8375 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8375  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 
437 aa  863    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.81 
 
 
367 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.78 
 
 
482 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.45 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  31.41 
 
 
377 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  31.07 
 
 
390 aa  132  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  33.1 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  32.03 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.7 
 
 
370 aa  130  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.63 
 
 
383 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.16 
 
 
371 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.7 
 
 
379 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.91 
 
 
394 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.8 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.14 
 
 
344 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  31.05 
 
 
368 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0470  oxidoreductase FAD-binding region  29.59 
 
 
388 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0481  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.59 
 
 
388 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.59 
 
 
388 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  29.39 
 
 
393 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.62 
 
 
382 aa  100  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.05 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0639  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.91 
 
 
388 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.78 
 
 
380 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0860  iron-sulfur cluster-binding protein/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  33.33 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.451181  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0984  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
330 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.13 
 
 
398 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  35.21 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.57 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2508  oxygenase, putative  31.94 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1091  ferredoxin oxidoreductase protein  36.36 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.09 
 
 
752 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  24.92 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  21.8 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  37.4 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.18 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.17 
 
 
328 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3526  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.03 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.28 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.52 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0164  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.27 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000937839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.65 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  22.76 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.77 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  22.38 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  24.4 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3143  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.24 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  22.77 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  22.92 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  22.12 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  29.27 
 
 
127 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  23.08 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0668  globin  23.13 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513137  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3654  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  23.53 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0203776  normal  0.336009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  22.47 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  20.93 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  32.87 
 
 
327 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0575  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.97 
 
 
321 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  21.52 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  21.9 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  21.9 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10390  hypothetical protein  29.36 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0586534  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  21.9 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  22.84 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  22.52 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.67 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  24.84 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  21.9 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  21.9 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3237  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.22 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  21.71 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  27.3 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  22.5 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  21.83 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.61 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2668  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.67 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  21.59 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  21.14 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0230  globin  20.76 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.39 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0224  globin  20.76 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  26.21 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.51 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  27.09 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  22.46 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  25.17 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  24.1 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.89 
 
 
360 aa  67  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  24.91 
 
 
406 aa  67  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.82 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.52 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  21.12 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  25.34 
 
 
402 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.28 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  26.53 
 
 
409 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  21.45 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  20.42 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.67 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2756  ferredoxin  26.67 
 
 
339 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.624393  normal  0.0265518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>