More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3805 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
407 aa  816    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0423  flavohemoprotein  50 
 
 
394 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50.26 
 
 
395 aa  362  8e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3202  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.72 
 
 
440 aa  352  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  50.75 
 
 
393 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  49.75 
 
 
398 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  49 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  48.77 
 
 
422 aa  343  4e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2937  globin  50 
 
 
404 aa  338  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000130596  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3526  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.38 
 
 
416 aa  326  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  48.99 
 
 
395 aa  326  5e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3143  oxidoreductase FAD-binding subunit  48.25 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2229  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.15 
 
 
409 aa  319  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3654  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.5 
 
 
412 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0203776  normal  0.336009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.39 
 
 
386 aa  293  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1541  6,7-dihydropteridine reductase  43.15 
 
 
407 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.233161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.3 
 
 
401 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.3 
 
 
401 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4884  6,7-dihydropteridine reductase  42.25 
 
 
414 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  44.14 
 
 
401 aa  285  9e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  42.75 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0668  globin  40.36 
 
 
386 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513137  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.28 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22150  hemoglobin-like flavoprotein  45.26 
 
 
433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.89 
 
 
399 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  39.95 
 
 
403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  40.6 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  43.29 
 
 
400 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.29 
 
 
400 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  41.29 
 
 
402 aa  259  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3991  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.51 
 
 
388 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.730708  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  38.61 
 
 
426 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.6 
 
 
399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  37.78 
 
 
400 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  39.05 
 
 
402 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  39.3 
 
 
402 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  39.3 
 
 
402 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  39.11 
 
 
402 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2019  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.2 
 
 
393 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  39.05 
 
 
402 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  39.05 
 
 
402 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  38.81 
 
 
402 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  38.56 
 
 
402 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  39.4 
 
 
402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  38.56 
 
 
402 aa  245  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  37.97 
 
 
402 aa  242  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  38.9 
 
 
399 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  38.9 
 
 
402 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.8 
 
 
402 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  38.9 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  38.42 
 
 
403 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  39.95 
 
 
413 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  38.65 
 
 
402 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  38.65 
 
 
402 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  38.96 
 
 
402 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  38.65 
 
 
402 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  38.9 
 
 
411 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  38.65 
 
 
402 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  39.8 
 
 
402 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  39.8 
 
 
402 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.91 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.05 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.3 
 
 
402 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  38.81 
 
 
402 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  39.05 
 
 
402 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  36.36 
 
 
397 aa  230  4e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  36.36 
 
 
397 aa  230  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  35.29 
 
 
410 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  36.76 
 
 
409 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  37.16 
 
 
414 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  37.37 
 
 
395 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.23 
 
 
403 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  36.91 
 
 
411 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  36.12 
 
 
396 aa  222  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  34.9 
 
 
399 aa  220  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  37.5 
 
 
393 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  33.83 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  39.2 
 
 
393 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  34.17 
 
 
396 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  34.49 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  39.4 
 
 
419 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  35.07 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  35.07 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  35.07 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  34.07 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  36.34 
 
 
393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  36.48 
 
 
414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  37.5 
 
 
409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  35.11 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  36.09 
 
 
393 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.62 
 
 
428 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  37.91 
 
 
393 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.93 
 
 
393 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  36.41 
 
 
403 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.47 
 
 
408 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  37.25 
 
 
392 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  37.41 
 
 
423 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.66 
 
 
394 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  34.83 
 
 
397 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  37.16 
 
 
414 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>