More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3397 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 
395 aa  798    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  56.82 
 
 
422 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  51.94 
 
 
399 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  49.87 
 
 
407 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0423  flavohemoprotein  49.87 
 
 
394 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  50.39 
 
 
393 aa  345  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2937  globin  51.02 
 
 
404 aa  345  7e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000130596  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3202  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.56 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3143  oxidoreductase FAD-binding subunit  49.87 
 
 
403 aa  338  9e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48.45 
 
 
398 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2229  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.57 
 
 
409 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  47.03 
 
 
395 aa  332  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3526  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.64 
 
 
416 aa  318  7.999999999999999e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3654  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.25 
 
 
412 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0203776  normal  0.336009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4884  6,7-dihydropteridine reductase  44.47 
 
 
414 aa  300  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.41 
 
 
386 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1541  6,7-dihydropteridine reductase  41.65 
 
 
407 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.233161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3991  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.04 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.730708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0668  globin  41.65 
 
 
386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.42 
 
 
399 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  42.71 
 
 
394 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  40.3 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  42.07 
 
 
429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22150  hemoglobin-like flavoprotein  41.87 
 
 
433 aa  272  7e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  43.51 
 
 
401 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.82 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  40.87 
 
 
400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.87 
 
 
400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.56 
 
 
401 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.76 
 
 
406 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2019  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.62 
 
 
393 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  38.87 
 
 
402 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.62 
 
 
402 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.93 
 
 
402 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  38.62 
 
 
402 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  38.68 
 
 
402 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  38.62 
 
 
399 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  38.36 
 
 
402 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  38.36 
 
 
402 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  38.36 
 
 
402 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  38.36 
 
 
402 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  38.36 
 
 
402 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  37.85 
 
 
402 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  37.85 
 
 
402 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  40.6 
 
 
403 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  38.42 
 
 
402 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.58 
 
 
402 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  39.9 
 
 
402 aa  242  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  37.85 
 
 
396 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  35.71 
 
 
400 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.69 
 
 
393 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  36.8 
 
 
426 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  36.8 
 
 
402 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.27 
 
 
394 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  35.48 
 
 
398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  37.91 
 
 
410 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  34.01 
 
 
394 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  36.36 
 
 
402 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  36.36 
 
 
402 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  36.18 
 
 
402 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  36.36 
 
 
402 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  35.93 
 
 
396 aa  229  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  35.93 
 
 
396 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  36.36 
 
 
402 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  35.93 
 
 
396 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  36.36 
 
 
402 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  35.93 
 
 
402 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  36.36 
 
 
402 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  38.11 
 
 
393 aa  225  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  35.61 
 
 
402 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  35.93 
 
 
396 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  38.13 
 
 
411 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  35.93 
 
 
396 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  35.55 
 
 
393 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  36.32 
 
 
393 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  35.93 
 
 
396 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  36.75 
 
 
402 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  35.68 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  35.68 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  34.01 
 
 
394 aa  222  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  34.09 
 
 
394 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  34.77 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  36.57 
 
 
393 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  35.86 
 
 
396 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  35.9 
 
 
392 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  36.83 
 
 
393 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  35.26 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.26 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  35.26 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  35.26 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  35.26 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  35.26 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  35.26 
 
 
396 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  35.01 
 
 
396 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  35.26 
 
 
396 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  36.6 
 
 
393 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  35.64 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  37.44 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  36.32 
 
 
393 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.42 
 
 
403 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>