More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2937 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2937  globin  100 
 
 		 404 aa  815    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000130596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3143  oxidoreductase FAD-binding subunit  82.92 
 
 		 403 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  54.98 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  52.61 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  50 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  51.45 
 
 		 395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0423  flavohemoprotein  47.76 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  51.24 
 
 		 395 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  51.11 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3202  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.41 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  48 
 
 		 422 aa  327  3e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3526  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  49.75 
 
 		 416 aa  326  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2229  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48.15 
 
 		 409 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2019  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.03 
 
 		 393 aa  315  6e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3991  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.19 
 
 		 388 aa  312  6.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.730708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3654  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.43 
 
 		 412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0203776  normal  0.336009 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  43.24 
 
 		 403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1541  6,7-dihydropteridine reductase  45.3 
 
 		 407 aa  298  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4884  6,7-dihydropteridine reductase  44.64 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.25 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  43.48 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  42.96 
 
 		 406 aa  289  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.73 
 
 		 401 aa  289  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.18 
 
 		 386 aa  289  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.24 
 
 		 401 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.52 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  44.17 
 
 		 394 aa  286  5e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  41.69 
 
 		 426 aa  285  9e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  44.01 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22150  hemoglobin-like flavoprotein  46.29 
 
 		 433 aa  282  7.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0668  globin  41.69 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513137  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  45.02 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.02 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  41.77 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.67 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  40.89 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.13 
 
 		 402 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  41.13 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  40.89 
 
 		 402 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  39.51 
 
 		 402 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  37.93 
 
 		 400 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  40.64 
 
 		 402 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  41.08 
 
 		 411 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  40.64 
 
 		 402 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  40.39 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  40.39 
 
 		 402 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  40.39 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.39 
 
 		 402 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  40.15 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  39.56 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  40.15 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  40.15 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  40.15 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  37.78 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  37.44 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  36.45 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  37.59 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  37.5 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  37.99 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  36.97 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  38.46 
 
 		 394 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  37.84 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  37.35 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.39 
 
 		 394 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  37.8 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  37.59 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  37.59 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  37.35 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  35.98 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  36.61 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  35.73 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  39.27 
 
 		 414 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  36.88 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  36.3 
 
 		 397 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  36.48 
 
 		 400 aa  242  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  35.78 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.97 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  39.12 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  36.03 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  34.39 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  37.01 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  35.78 
 
 		 397 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  35.22 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  35.22 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  34.57 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  35.54 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  35.78 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  34.98 
 
 		 396 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  40.05 
 
 		 413 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  38.77 
 
 		 414 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.28 
 
 		 403 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  36.19 
 
 		 392 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07160  response to stress-related protein, putative  35.92 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  36.19 
 
 		 392 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  36.19 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  37.65 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  34.47 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  38.78 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  37.32 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.57 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>