More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3287 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  87.03 
 
 		 401 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  99.75 
 
 		 401 aa  813    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 		 401 aa  815    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  63.05 
 
 		 406 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  61.08 
 
 		 429 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  52.11 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  44.99 
 
 		 403 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.75 
 
 		 399 aa  318  7e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  45.57 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  44.55 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  45.57 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  45.32 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  45.14 
 
 		 402 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  44.56 
 
 		 402 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  45.32 
 
 		 402 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  45.32 
 
 		 402 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  45.32 
 
 		 402 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  45.32 
 
 		 402 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.91 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.3 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.89 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3143  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.81 
 
 		 403 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  42.16 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2937  globin  43.73 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000130596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2229  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  44.11 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  43.86 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  43.86 
 
 		 411 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  41.96 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  39.5 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  42.46 
 
 		 402 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  41.1 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  41.52 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.61 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.73 
 
 		 399 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  41.48 
 
 		 402 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  41.83 
 
 		 402 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  41.48 
 
 		 402 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  41.23 
 
 		 402 aa  285  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  41.23 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  39.21 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  41.28 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3202  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.77 
 
 		 440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  44.25 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.88 
 
 		 395 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0423  flavohemoprotein  42.14 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  40.65 
 
 		 402 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.18 
 
 		 398 aa  279  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  39.9 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  39.9 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  41.29 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.45 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  39.35 
 
 		 395 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.35 
 
 		 403 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  42.54 
 
 		 422 aa  266  4e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  41.75 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  37.66 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3991  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.18 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.730708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  37.66 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  37.41 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  38.06 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  40.75 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1541  6,7-dihydropteridine reductase  42.89 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1514  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.5 
 
 		 402 aa  259  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.156255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  38.06 
 
 		 396 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  38.06 
 
 		 396 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  38.75 
 
 		 396 aa  259  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  37.75 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  40.3 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  38.06 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2019  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.03 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  38 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  37.97 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.97 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  37.97 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  37.97 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  38.21 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  37.97 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  39.35 
 
 		 411 aa  256  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  39.85 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  37.97 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  37.97 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  37.72 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3526  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.5 
 
 		 416 aa  254  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  37.59 
 
 		 397 aa  253  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  37.59 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  40.1 
 
 		 413 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.89 
 
 		 394 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0668  globin  39.56 
 
 		 386 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513137  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22150  hemoglobin-like flavoprotein  40.87 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  37.34 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3654  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.25 
 
 		 412 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0203776  normal  0.336009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  37.93 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.25 
 
 		 408 aa  249  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  37.68 
 
 		 397 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  37.93 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  39.4 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  38.86 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  39.6 
 
 		 414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  37.44 
 
 		 397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>