More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4119 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  93.28 
 
 
372 aa  707    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  100 
 
 
403 aa  819    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.42 
 
 
367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.64 
 
 
482 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  42.35 
 
 
390 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  44.26 
 
 
371 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.07 
 
 
394 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.94 
 
 
379 aa  255  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  40.28 
 
 
377 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.6 
 
 
370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.42 
 
 
372 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  40.66 
 
 
368 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.89 
 
 
371 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.26 
 
 
383 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.44 
 
 
383 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0470  oxidoreductase FAD-binding region  36.86 
 
 
388 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0481  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.86 
 
 
388 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0255  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.33 
 
 
380 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.348367  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.4 
 
 
407 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.89 
 
 
388 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0639  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.77 
 
 
388 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10390  hypothetical protein  35.92 
 
 
425 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0586534  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.58 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0860  iron-sulfur cluster-binding protein/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  34.13 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.451181  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0984  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.13 
 
 
330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386753 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.19 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8375  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.1 
 
 
437 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.59 
 
 
372 aa  113  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  34.93 
 
 
350 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  25.84 
 
 
397 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  25.84 
 
 
397 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.65 
 
 
342 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.05 
 
 
345 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  24.94 
 
 
403 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  31.88 
 
 
327 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.86 
 
 
399 aa  100  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  31.73 
 
 
338 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.73 
 
 
338 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  24.94 
 
 
400 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1091  ferredoxin oxidoreductase protein  34.6 
 
 
328 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.32 
 
 
328 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.4 
 
 
340 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  23.9 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  26.4 
 
 
402 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  30.09 
 
 
369 aa  97.4  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5674  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.77 
 
 
332 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0772  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.64 
 
 
321 aa  97.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.96 
 
 
353 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  26.92 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  25.26 
 
 
394 aa  96.3  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2723  anthranilate dioxygenase reductase  36 
 
 
340 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.46 
 
 
336 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  26.12 
 
 
409 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  32.23 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.5 
 
 
354 aa  95.5  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32140  anthranilate dioxygenase reductase  36.23 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3561  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.09 
 
 
343 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4637  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.09 
 
 
343 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.217006  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  25.38 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1311  oxidoreductase FAD-binding region  33.02 
 
 
340 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.577978  normal  0.18536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  26.34 
 
 
411 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  28.95 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.5 
 
 
343 aa  93.6  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.87 
 
 
393 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.41 
 
 
402 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0164  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.18 
 
 
331 aa  93.2  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000937839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.69 
 
 
340 aa  92.8  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2280  phenol hydrolase reductase  31.25 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.01 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.89 
 
 
752 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  26.15 
 
 
403 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  25.19 
 
 
402 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.99 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.92 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.99 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.31 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.89 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4410  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.9 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.421266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.89 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.89 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.9 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.65 
 
 
365 aa  91.3  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.01 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.63 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.52 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.89 
 
 
343 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.75 
 
 
328 aa  91.3  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.57 
 
 
348 aa  90.9  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.84 
 
 
354 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  22.78 
 
 
397 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.73 
 
 
349 aa  90.1  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.44 
 
 
343 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29 
 
 
342 aa  90.1  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.31 
 
 
351 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  25.08 
 
 
402 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
337 aa  89.7  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.7 
 
 
348 aa  89.7  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.44 
 
 
357 aa  89.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  24.94 
 
 
402 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  24.94 
 
 
402 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>