52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1439 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  43.8 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  38.64 
 
 		 127 aa  85.5  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 		 838 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.51 
 
 		 367 aa  72.4  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.54 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  34.21 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  30.65 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.4 
 
 		 482 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.14 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  34.06 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  26.32 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  26.32 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.41 
 
 		 370 aa  61.6  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  33.63 
 
 		 403 aa  61.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  31.03 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  32.59 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  32.74 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.6 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.63 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  35 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  33.63 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.29 
 
 		 394 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  28.7 
 
 		 390 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  29.37 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  29.37 
 
 		 396 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  28.24 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  29.81 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.95 
 
 		 371 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.65 
 
 		 383 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 368 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  32.33 
 
 		 371 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  26.77 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  29.77 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  19.72 
 
 		 398 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  26.56 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10390  hypothetical protein  38.46 
 
 		 425 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0586534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  23.45 
 
 		 403 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  25.98 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  25.55 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1717  globin  24.63 
 
 		 140 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  25.19 
 
 		 395 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46237  predicted protein  25.52 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.42 
 
 		 383 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.27 
 
 		 395 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8375  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.15 
 
 		 437 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  20.42 
 
 		 396 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2494  globin  26.39 
 
 		 143 aa  42  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32831  hypothetical protein  22.64 
 
 		 348 aa  42  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  25.76 
 
 		 422 aa  41.2  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.55 
 
 		 393 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.8 
 
 		 399 aa  40.8  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>