48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46237 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46237  predicted protein  100 
 
 
202 aa  425  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  31.88 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  33.83 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  31.21 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.59 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.39 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  28.57 
 
 
137 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  26.58 
 
 
153 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  26.58 
 
 
153 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  29.82 
 
 
142 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  29.41 
 
 
368 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  29.1 
 
 
157 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  27.82 
 
 
139 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.22 
 
 
371 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  30.51 
 
 
127 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  29.37 
 
 
377 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.41 
 
 
482 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  32.04 
 
 
140 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  25.55 
 
 
135 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  33.98 
 
 
141 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.1 
 
 
379 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.36 
 
 
838 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.72 
 
 
383 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  33.33 
 
 
140 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.3 
 
 
370 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.91 
 
 
393 aa  51.2  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  29.66 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  27.91 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  30 
 
 
402 aa  48.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  25.71 
 
 
371 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  31.4 
 
 
402 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  34.62 
 
 
402 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  31.4 
 
 
402 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  31.4 
 
 
402 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  31.4 
 
 
402 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  31.4 
 
 
402 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  31.4 
 
 
402 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  31.4 
 
 
402 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  31.4 
 
 
402 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  31.4 
 
 
402 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  23.66 
 
 
395 aa  45.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  28.43 
 
 
390 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.86 
 
 
394 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  25.42 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  25.52 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  28.26 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  28.26 
 
 
144 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  26.28 
 
 
402 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>