189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3532 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3532  globin  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  74.44 
 
 		 137 aa  214  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  70.07 
 
 		 137 aa  206  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  63.64 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  55.38 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  51.16 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  52.31 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  48.06 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  46.51 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.54 
 
 		 838 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  39.53 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  43.65 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  40.5 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  36.15 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  43.36 
 
 		 142 aa  94.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  34.11 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  35.59 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  40.98 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.2 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.07 
 
 		 371 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  34.62 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  36.89 
 
 		 390 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  33.06 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  33.06 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1717  globin  31.3 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  31.5 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.4 
 
 		 370 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  33.59 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  38.78 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.94 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.64 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  24.81 
 
 		 398 aa  63.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46237  predicted protein  28.57 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  26.09 
 
 		 394 aa  62  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  30.63 
 
 		 403 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  31.71 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  24.62 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  26.36 
 
 		 400 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  29.55 
 
 		 411 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  24.62 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  33.02 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.73 
 
 		 372 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.95 
 
 		 482 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.25 
 
 		 399 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  27.83 
 
 		 396 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.6 
 
 		 407 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  29.85 
 
 		 403 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  27.48 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.82 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  32.29 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.82 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  31.03 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  28.57 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  26.83 
 
 		 396 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  26.12 
 
 		 410 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.03 
 
 		 428 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.93 
 
 		 394 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  25.38 
 
 		 397 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  25.38 
 
 		 397 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  28.3 
 
 		 403 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  25.38 
 
 		 397 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  25.38 
 
 		 397 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  32.71 
 
 		 403 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  25.37 
 
 		 397 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  25.37 
 
 		 397 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  23.48 
 
 		 393 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.68 
 
 		 383 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  30.56 
 
 		 400 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  25.38 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  25.38 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  25.38 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  25.38 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  25.38 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  25.38 
 
 		 402 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.27 
 
 		 403 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  25.38 
 
 		 402 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  25.76 
 
 		 396 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  25.38 
 
 		 402 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  28.1 
 
 		 397 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  26.52 
 
 		 396 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  24.24 
 
 		 396 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32831  hypothetical protein  27.88 
 
 		 348 aa  51.2  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  27.07 
 
 		 393 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  30.63 
 
 		 409 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  27.82 
 
 		 393 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  24.62 
 
 		 402 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  25.38 
 
 		 397 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  25.38 
 
 		 397 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  24.62 
 
 		 402 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0639  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.63 
 
 		 388 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  28.69 
 
 		 401 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  27.82 
 
 		 393 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.19 
 
 		 406 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  29.47 
 
 		 402 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  23.48 
 
 		 396 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  21.97 
 
 		 394 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.77 
 
 		 388 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  23.48 
 
 		 396 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  23.48 
 
 		 396 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  23.48 
 
 		 396 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>