170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1891 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  100 
 
 		 142 aa  290  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  52.71 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  51.18 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  48.18 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  44.62 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  45.22 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  45.11 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  42.86 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  44.44 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  42.48 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  40 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  43.36 
 
 		 137 aa  94.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  39.71 
 
 		 157 aa  94.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.16 
 
 		 367 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  40.31 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  37.3 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.9 
 
 		 838 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.23 
 
 		 370 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  33.33 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  35.61 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  33.59 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.8 
 
 		 371 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  28.89 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.45 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  29.37 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  29.37 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.15 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.91 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  32.03 
 
 		 390 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.76 
 
 		 482 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  30.65 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.17 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  29.6 
 
 		 396 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  32.58 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1717  globin  29.03 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.86 
 
 		 372 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.03 
 
 		 399 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46237  predicted protein  29.82 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  28.57 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  37.18 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  30.7 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  35.19 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  27.2 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  31.25 
 
 		 422 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  25 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  26.4 
 
 		 400 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.23 
 
 		 395 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  29.13 
 
 		 394 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  28.57 
 
 		 402 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.08 
 
 		 383 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  27.1 
 
 		 398 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.62 
 
 		 399 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  28.35 
 
 		 396 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  28 
 
 		 395 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  28.04 
 
 		 394 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  28.35 
 
 		 396 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.25 
 
 		 394 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  26.4 
 
 		 411 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  29.13 
 
 		 396 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  29.13 
 
 		 394 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  27.03 
 
 		 399 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  24.11 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  30.88 
 
 		 403 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.34 
 
 		 393 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  27.56 
 
 		 396 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.56 
 
 		 396 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  27.56 
 
 		 396 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  31.3 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  28.97 
 
 		 397 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  27.56 
 
 		 396 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.63 
 
 		 407 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  28.57 
 
 		 393 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  29.13 
 
 		 394 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  27.56 
 
 		 396 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  27.56 
 
 		 396 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  27.56 
 
 		 396 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  27.56 
 
 		 396 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  27.56 
 
 		 396 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  26.77 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07160  response to stress-related protein, putative  28.93 
 
 		 504 aa  48.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  26.77 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  31.58 
 
 		 393 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  26.77 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  28.69 
 
 		 401 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  28.44 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.43 
 
 		 398 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  26.77 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  25.6 
 
 		 395 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  29.69 
 
 		 394 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  27.82 
 
 		 409 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  26.77 
 
 		 396 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  31.19 
 
 		 429 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  28.04 
 
 		 397 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  28.04 
 
 		 397 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  28.04 
 
 		 397 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  28.04 
 
 		 397 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.8 
 
 		 428 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  31.03 
 
 		 395 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>