195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1756 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1756  globin  100 
 
 		 139 aa  276  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  71.74 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  65.44 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  68.7 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  48.15 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  52.31 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  52.31 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  46.62 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  45.86 
 
 		 137 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  45.11 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  45.93 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  45.53 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.62 
 
 		 838 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  51.18 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  42.45 
 
 		 157 aa  110  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  42.96 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  40.88 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  39.06 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.46 
 
 		 371 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  37.4 
 
 		 377 aa  86.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  34.35 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  34.35 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.85 
 
 		 367 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  35.51 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  35.51 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  36.72 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  35.43 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  30.83 
 
 		 400 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  30.47 
 
 		 396 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  31.21 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.21 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  31.97 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  31.97 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  31.21 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  31.21 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  31.21 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  31.21 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  31.21 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  31.34 
 
 		 396 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  31.34 
 
 		 396 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  30.47 
 
 		 396 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  31.34 
 
 		 396 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.78 
 
 		 394 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  34.26 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1717  globin  29.85 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  29.41 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  30.77 
 
 		 396 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  34.86 
 
 		 395 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.29 
 
 		 407 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  34.31 
 
 		 400 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  30.77 
 
 		 396 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  33.33 
 
 		 396 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  30.88 
 
 		 396 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  31.85 
 
 		 410 aa  67  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  37.38 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  37.39 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  31.54 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  31.5 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.58 
 
 		 394 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  35.51 
 
 		 394 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  30.08 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  30 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  30 
 
 		 396 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  30 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  31.19 
 
 		 394 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  30.71 
 
 		 403 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.08 
 
 		 370 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  31.3 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.4 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  30.84 
 
 		 394 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.78 
 
 		 393 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  30.83 
 
 		 397 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  35.4 
 
 		 393 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  34.58 
 
 		 397 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.93 
 
 		 482 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  30.83 
 
 		 397 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  33.05 
 
 		 394 aa  61.6  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  30.6 
 
 		 426 aa  61.6  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  32.71 
 
 		 397 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  32.71 
 
 		 397 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  32.71 
 
 		 397 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  32.71 
 
 		 397 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.92 
 
 		 372 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.76 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  32.12 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  32.12 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  32.12 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  32.12 
 
 		 399 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  32.12 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.6 
 
 		 428 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  32.12 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  32.85 
 
 		 422 aa  60.1  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.39 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.58 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  30.28 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  34.58 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  34.58 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  31.39 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.39 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>