200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2821 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  100 
 
 		 141 aa  286  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  71.74 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  63.85 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  56.62 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  55.04 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  46.27 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  48.06 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  46.21 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  47.97 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 		 838 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  42.22 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  44.7 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  45 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  43.94 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  41.43 
 
 		 146 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.24 
 
 		 371 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  41.91 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  40 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  40 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  45.11 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  42.06 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.93 
 
 		 367 aa  97.1  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  37.59 
 
 		 377 aa  93.6  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  39.23 
 
 		 371 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.64 
 
 		 482 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  39.83 
 
 		 368 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.28 
 
 		 379 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.5 
 
 		 394 aa  83.6  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.07 
 
 		 372 aa  83.6  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.78 
 
 		 383 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1717  globin  29.77 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  37.33 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  34.86 
 
 		 400 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.88 
 
 		 370 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  39.42 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  35.14 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  32.12 
 
 		 400 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.94 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  31.48 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  35.45 
 
 		 396 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.45 
 
 		 396 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  35.45 
 
 		 396 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  35.45 
 
 		 396 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  35.45 
 
 		 396 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  35.78 
 
 		 396 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  35.14 
 
 		 396 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  35.45 
 
 		 396 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  35.45 
 
 		 396 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  35.45 
 
 		 396 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  36.36 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.34 
 
 		 394 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  35.78 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  35.78 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  35.78 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  35.78 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  31.29 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  32.41 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  28.89 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  30.56 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  28.37 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  28.37 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  28.37 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  32.09 
 
 		 426 aa  68.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.06 
 
 		 399 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  31.86 
 
 		 399 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  32.58 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  28.79 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.48 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  28.79 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  32.48 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  28.57 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  33.61 
 
 		 402 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  33.61 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  28.68 
 
 		 396 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 		 394 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  28.15 
 
 		 410 aa  64.3  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  34.06 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  29.32 
 
 		 393 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.78 
 
 		 372 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  28.28 
 
 		 411 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1757  flavohemoprotein, truncation  30.15 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1574  flavohemoprotein, truncation  30.15 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  33.33 
 
 		 397 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  33.33 
 
 		 397 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  33.33 
 
 		 397 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  29.32 
 
 		 402 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  33.33 
 
 		 397 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  32 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  29.32 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  31.78 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0148  globin  36.7 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  32 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  30.77 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  30.77 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  29.32 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  29.32 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  29.32 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  29.32 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  29.32 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>