164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0207 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0207  globin  100 
 
 		 137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  82.22 
 
 		 137 aa  239  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  74.44 
 
 		 137 aa  214  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  64.44 
 
 		 141 aa  183  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  51.16 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  50 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  46.62 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  44.7 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  41.09 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 838 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  45.22 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  39.53 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  38.14 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  40.62 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  36.36 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.4 
 
 		 367 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  34.62 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  39.69 
 
 		 371 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  33.9 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.61 
 
 		 370 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  33.06 
 
 		 377 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.61 
 
 		 371 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  31.15 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  31.15 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46237  predicted protein  31.21 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1717  globin  29.01 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  35.58 
 
 		 368 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.65 
 
 		 394 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.73 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.08 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  28.83 
 
 		 403 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  27.87 
 
 		 396 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  32 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  33.02 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  31.78 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2209  hemoglobin  25.95 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967151  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.83 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1921  hemoglobin  26.15 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 		 394 aa  58.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.04 
 
 		 482 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  24.03 
 
 		 398 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0084  globin  28.23 
 
 		 178 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  27.13 
 
 		 400 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3564  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.87 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  26.12 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  29.37 
 
 		 403 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  25.56 
 
 		 402 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.36 
 
 		 399 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  29.51 
 
 		 409 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  30.77 
 
 		 397 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  30.77 
 
 		 397 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  30.77 
 
 		 397 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  30.77 
 
 		 397 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  27.74 
 
 		 397 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  29.06 
 
 		 397 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  27.74 
 
 		 397 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  29.63 
 
 		 402 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.91 
 
 		 428 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.27 
 
 		 394 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  25.4 
 
 		 403 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 402 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 402 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 402 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 402 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4918  globin  26.4 
 
 		 215 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163217  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.1 
 
 		 406 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 402 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 402 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  26.15 
 
 		 397 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  26.15 
 
 		 397 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  31.58 
 
 		 402 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  30.21 
 
 		 399 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  25.19 
 
 		 426 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 402 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 402 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  24.59 
 
 		 396 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  28.15 
 
 		 402 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  29.63 
 
 		 402 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  29.66 
 
 		 393 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  24.63 
 
 		 410 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  23.31 
 
 		 393 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3143  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.01 
 
 		 403 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  29.03 
 
 		 401 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  27.36 
 
 		 396 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  29.13 
 
 		 429 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.43 
 
 		 383 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  31.25 
 
 		 401 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0148  globin  29.91 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  28.04 
 
 		 400 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  27.41 
 
 		 395 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  25.47 
 
 		 396 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32831  hypothetical protein  27.88 
 
 		 348 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  25.47 
 
 		 396 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  30.17 
 
 		 422 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  25.47 
 
 		 396 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.36 
 
 		 388 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  25.47 
 
 		 396 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0492  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.04 
 
 		 382 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>